62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3674 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  100 
 
 		 169 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  62.05 
 
 		 175 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  59.06 
 
 		 197 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  60.9 
 
 		 175 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  58.48 
 
 		 197 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  33.95 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  32.05 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  30.86 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  31.41 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  30.25 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  30.86 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  30.46 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  29.88 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  28.24 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  27.95 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  27.95 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  31.5 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  31.5 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  31.5 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  31.5 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  31.5 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  31.5 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  30.71 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  34.39 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  34.39 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  33.76 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  33.76 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  33.76 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  33.12 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  32.48 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  26.75 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  26.75 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  27.04 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  27.81 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  26.42 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  28.04 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  28.04 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  28.04 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  28.04 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  27.81 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  28.04 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  27.22 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  30.23 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  28.16 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  29.32 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  27.81 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  25.16 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  27.32 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  30.33 
 
 		 339 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  28.57 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  27.22 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  27.5 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  26.42 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  23.23 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  27.61 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  26.58 
 
 		 177 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  29.49 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  29.69 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  28 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  25 
 
 		 184 aa  40.8  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  25.81 
 
 		 178 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.488322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>