61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3660 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  100 
 
 		 232 aa  480  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  45.41 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  44.25 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  44.29 
 
 		 215 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  38.5 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  38.57 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  37.5 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  37.27 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  38.36 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  39.9 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  37.12 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  50.38 
 
 		 133 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 229 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  35.38 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  35.38 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  33.65 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  35.02 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  32.03 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  32.03 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  33.79 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  39.37 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  27.91 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  40.23 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  39.08 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  28.5 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.7 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  40.91 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  26.13 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  32.65 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  36.96 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  38.64 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  36.7 
 
 		 236 aa  62  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  25 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  24.54 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.63 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  30.3 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  24.19 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  37.5 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  31.73 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  24.2 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  27.69 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  29.91 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  23.73 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  34.88 
 
 		 126 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.07 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  30.77 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  31.13 
 
 		 153 aa  45.1  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  23.27 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  29.45 
 
 		 186 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>