42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3648 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  100 
 
 		 216 aa  447  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  75 
 
 		 216 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  75 
 
 		 225 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  75.6 
 
 		 214 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  74.52 
 
 		 216 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  73.3 
 
 		 223 aa  327  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  71.9 
 
 		 223 aa  324  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  71.15 
 
 		 216 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  65.55 
 
 		 223 aa  308  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  62.93 
 
 		 237 aa  284  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  64.39 
 
 		 210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  44.28 
 
 		 223 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  35.83 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  34.78 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  31.58 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 		 212 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  30.37 
 
 		 212 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  29.95 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000278112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 		 216 aa  105  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7239  GCN5-related N-acetyltransferase  24.24 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343936  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  19.29 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4434  hypothetical protein  25.13 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  22.22 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1182  acetyltransferase  22.99 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000296086  decreased coverage  0.00782832 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  34.12 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  32.46 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  21.15 
 
 		 215 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  24.14 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 		 198 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>