More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3639 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 
554 aa  718    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  58 
 
 
562 aa  662    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 
554 aa  718    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 
554 aa  718    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 
554 aa  718    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  56.56 
 
 
573 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  64.75 
 
 
554 aa  763    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  88.54 
 
 
567 aa  1051    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 
566 aa  647    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  61.78 
 
 
556 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  61.23 
 
 
555 aa  694    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  58 
 
 
580 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  60.66 
 
 
556 aa  705    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 
569 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  60.33 
 
 
556 aa  683    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  61.59 
 
 
556 aa  700    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  90.96 
 
 
569 aa  1081    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  62.71 
 
 
560 aa  729    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 
551 aa  665    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 
551 aa  663    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  61.59 
 
 
556 aa  696    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 
556 aa  691    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  90.6 
 
 
564 aa  1077    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
579 aa  668    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.450969  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  62.66 
 
 
554 aa  716    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
609 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  63.87 
 
 
559 aa  737    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  88.36 
 
 
567 aa  1050    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 
565 aa  665    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 
559 aa  699    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  61.41 
 
 
556 aa  697    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  63.14 
 
 
558 aa  755    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
566 aa  1179    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 
556 aa  687    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  82.86 
 
 
555 aa  985    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 
572 aa  729    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 
582 aa  678    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  64.78 
 
 
553 aa  757    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0814  glutaminyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 
597 aa  671    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000834243  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 
568 aa  698    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 
781 aa  650    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 
559 aa  657    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  62.48 
 
 
554 aa  708    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  59.36 
 
 
565 aa  689    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 
569 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
778 aa  645    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 
554 aa  718    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 
561 aa  712    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 
556 aa  712    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  61.79 
 
 
563 aa  719    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  88.18 
 
 
567 aa  1050    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  62.66 
 
 
555 aa  720    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  62.66 
 
 
554 aa  717    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  62.97 
 
 
590 aa  742    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 
579 aa  672    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  61.61 
 
 
559 aa  714    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 
569 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
596 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  62.96 
 
 
555 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 
569 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  61.48 
 
 
556 aa  692    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 
705 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 
570 aa  687    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 
561 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  62.52 
 
 
556 aa  713    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  66.73 
 
 
576 aa  779    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 
555 aa  703    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  60.33 
 
 
558 aa  697    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0665  glutaminyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
579 aa  668    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0340381  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  57.44 
 
 
582 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 
569 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  62.96 
 
 
555 aa  708    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  62.96 
 
 
555 aa  708    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  62.66 
 
 
555 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 
580 aa  701    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 
559 aa  677    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  60.76 
 
 
558 aa  689    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 
553 aa  698    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 
552 aa  671    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  60 
 
 
552 aa  672    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  61.97 
 
 
548 aa  701    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  61.96 
 
 
556 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  61.78 
 
 
556 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  62.57 
 
 
556 aa  702    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 
569 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 
589 aa  684    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 
561 aa  699    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 
569 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  84.86 
 
 
556 aa  992    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  62.66 
 
 
555 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  62.12 
 
 
568 aa  738    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 
556 aa  700    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  59.43 
 
 
564 aa  712    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 
576 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  61.96 
 
 
556 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  61.78 
 
 
571 aa  697    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 
565 aa  717    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  84.16 
 
 
561 aa  993    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  88.71 
 
 
567 aa  1054    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 
557 aa  719    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>