More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3614 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  73.37 
 
 		 509 aa  727    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  73.37 
 
 		 509 aa  727    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  72.78 
 
 		 509 aa  720    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4130  NADH dehydrogenase subunit M  90.59 
 
 		 510 aa  838    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1010  NADH dehydrogenase subunit M  68.32 
 
 		 514 aa  684    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3376  NADH dehydrogenase I, M subunit  92.16 
 
 		 510 aa  868    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  74.3 
 
 		 510 aa  733    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3208  NADH dehydrogenase subunit M  91.96 
 
 		 510 aa  868    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281414  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  73.37 
 
 		 509 aa  727    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  79.61 
 
 		 509 aa  770    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  72.58 
 
 		 509 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  72.78 
 
 		 509 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  72.78 
 
 		 509 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  73.85 
 
 		 509 aa  703    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  72.16 
 
 		 509 aa  738    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3614  NADH dehydrogenase subunit M  100 
 
 		 510 aa  1006    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  73.37 
 
 		 509 aa  727    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  72.11 
 
 		 532 aa  710    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1735  NADH dehydrogenase subunit M  90.78 
 
 		 510 aa  839    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00591275  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  80.98 
 
 		 509 aa  789    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1862  NADH dehydrogenase subunit M  91.18 
 
 		 510 aa  866    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  0.0328463 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  73.37 
 
 		 509 aa  727    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  73.18 
 
 		 509 aa  725    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3702  NADH dehydrogenase subunit M  90.78 
 
 		 510 aa  839    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.65414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  74.9 
 
 		 511 aa  725    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  75.1 
 
 		 511 aa  729    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  73.37 
 
 		 509 aa  727    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  67.4 
 
 		 513 aa  663    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  73.37 
 
 		 509 aa  727    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  72.78 
 
 		 509 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  80.67 
 
 		 509 aa  808    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  74.3 
 
 		 510 aa  733    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  73.37 
 
 		 509 aa  727    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  80.87 
 
 		 509 aa  810    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2539  NADH dehydrogenase subunit M  70.52 
 
 		 511 aa  702    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  74.3 
 
 		 510 aa  734    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0595  NADH dehydrogenase subunit M  61.92 
 
 		 541 aa  621  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0584  NADH dehydrogenase subunit M  61.92 
 
 		 541 aa  619  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0370  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  60.8 
 
 		 507 aa  600  1e-170  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1688  NADH dehydrogenase subunit M  57.25 
 
 		 577 aa  578  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.694136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1024  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.01 
 
 		 500 aa  488  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1116  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.66 
 
 		 493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1348  NADH dehydrogenase I, M subunit  54.91 
 
 		 489 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.467461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.2 
 
 		 490 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1109  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.6 
 
 		 505 aa  450  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.47 
 
 		 537 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0408599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0707  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53 
 
 		 493 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.296941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.74 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.94 
 
 		 525 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  44.59 
 
 		 496 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.4 
 
 		 497 aa  361  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  38.66 
 
 		 522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0171  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.42 
 
 		 496 aa  353  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.87 
 
 		 519 aa  352  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.14 
 
 		 495 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.56 
 
 		 535 aa  349  8e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  38.67 
 
 		 496 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1337  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.29 
 
 		 481 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  39.48 
 
 		 501 aa  343  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  38.67 
 
 		 496 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.31 
 
 		 535 aa  342  9e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  39.71 
 
 		 496 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  39.18 
 
 		 502 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  39.51 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4060  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.2 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.40537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  39.51 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  39.51 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.14 
 
 		 534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  38.52 
 
 		 502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.45 
 
 		 504 aa  340  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  40.04 
 
 		 494 aa  340  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  39.31 
 
 		 496 aa  339  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  38.52 
 
 		 502 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.68 
 
 		 507 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  39.18 
 
 		 496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  39.1 
 
 		 496 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  39.1 
 
 		 496 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  39.1 
 
 		 496 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  39.1 
 
 		 496 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  39.1 
 
 		 496 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  39.1 
 
 		 496 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  39.6 
 
 		 494 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  39.1 
 
 		 496 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.6 
 
 		 494 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.83 
 
 		 503 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4732  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.29 
 
 		 480 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0939  NADH dehydrogenase subunit M  37.83 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.573933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1997  NADH dehydrogenase subunit M  39.59 
 
 		 497 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425538  normal  0.176809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.72 
 
 		 517 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  37.63 
 
 		 488 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.13 
 
 		 535 aa  333  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1358  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.67 
 
 		 481 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199626  normal  0.187922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 		 503 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.88 
 
 		 542 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.69 
 
 		 542 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.69 
 
 		 542 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.6 
 
 		 507 aa  329  7e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6082  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.05 
 
 		 519 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0973  NADH dehydrogenase subunit M  37.63 
 
 		 488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0836349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  39.61 
 
 		 510 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>