More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3607 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  77.49 
 
 		 445 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.49 
 
 		 445 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  77.73 
 
 		 445 aa  687    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  77.49 
 
 		 445 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4123  NADH dehydrogenase I subunit F  89.85 
 
 		 453 aa  842    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  77.49 
 
 		 445 aa  686    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1017  NADH dehydrogenase I subunit F  84.26 
 
 		 461 aa  760    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3369  NADH dehydrogenase I, F subunit  90.27 
 
 		 452 aa  839    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2566  NADH dehydrogenase I subunit F  87.14 
 
 		 448 aa  820    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3201  NADH dehydrogenase I subunit F  90.27 
 
 		 452 aa  842    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103684  normal  0.0135586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3607  NADH dehydrogenase I subunit F  100 
 
 		 451 aa  925    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  77.49 
 
 		 445 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  77.73 
 
 		 445 aa  687    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  77.73 
 
 		 445 aa  687    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  77.73 
 
 		 445 aa  687    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1742  NADH dehydrogenase I subunit F  89.85 
 
 		 453 aa  842    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00767478  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  77.49 
 
 		 445 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.793863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  78.4 
 
 		 449 aa  694    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  78.72 
 
 		 449 aa  691    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  77.49 
 
 		 445 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28480  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  86.14 
 
 		 449 aa  781    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  77.49 
 
 		 445 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  76.04 
 
 		 461 aa  686    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3695  NADH dehydrogenase I subunit F  89.87 
 
 		 454 aa  843    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  76.04 
 
 		 461 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2546  NADH dehydrogenase I subunit F  77.07 
 
 		 449 aa  663    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2416  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  85.32 
 
 		 448 aa  786    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0718255  normal  0.148536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  76.3 
 
 		 450 aa  675    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  78.2 
 
 		 445 aa  689    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29970  NADH dehydrogenase I subunit F  81.19 
 
 		 449 aa  744    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1398  NADH dehydrogenase I subunit F  74.72 
 
 		 449 aa  660    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.940574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  76.04 
 
 		 461 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  77.49 
 
 		 445 aa  686    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1869  NADH dehydrogenase I subunit F  89.82 
 
 		 458 aa  841    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.123144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  77.73 
 
 		 445 aa  687    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0377  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.81 
 
 		 444 aa  624  1e-177  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.372414  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3128  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.28 
 
 		 446 aa  526  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0588  NADH dehydrogenase I, F subunit  60.84 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0577  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.07 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1695  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.39 
 
 		 537 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.316564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  57.14 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.9 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.01 
 
 		 454 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.46 
 
 		 426 aa  465  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.98 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1116  NADH dehydrogenase (quinone)  51.68 
 
 		 434 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0714  NADH dehydrogenase (quinone)  54.91 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.24 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.12 
 
 		 438 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3441  NADH dehydrogenase I, F subunit  50.12 
 
 		 423 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0157  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  50.12 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.35 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.88 
 
 		 422 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.22 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.75 
 
 		 706 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0158  NADH dehydrogenase (quinone)  48.43 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4067  NADH dehydrogenase (quinone)  49.28 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0902793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.76 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.8 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0208  NADH dehydrogenase I chain F  49.64 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0329  NADH dehydrogenase (quinone)  46.68 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0176  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  47.71 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  48.33 
 
 		 449 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  46.9 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.1 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.52 
 
 		 434 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  46.59 
 
 		 424 aa  372  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.37 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.49 
 
 		 441 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  49.12 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.45 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.62 
 
 		 444 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.63 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1880  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.71 
 
 		 441 aa  363  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.65 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.04 
 
 		 438 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.48 
 
 		 444 aa  361  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  45.89 
 
 		 428 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.8 
 
 		 438 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.8 
 
 		 438 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.99 
 
 		 442 aa  359  5e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  46.77 
 
 		 428 aa  358  8e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.82 
 
 		 438 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.16 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.52 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.52 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.2 
 
 		 448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.71 
 
 		 443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.48 
 
 		 443 aa  350  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.06 
 
 		 456 aa  350  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.48 
 
 		 443 aa  350  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1693  NADH dehydrogenase (quinone)  45.82 
 
 		 416 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0681624  normal  0.883791 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  42.66 
 
 		 545 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  43.13 
 
 		 545 aa  346  6e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.21 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1740  NADH dehydrogenase (quinone)  46.06 
 
 		 416 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0104  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  45.82 
 
 		 416 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.85 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1279  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  46.6 
 
 		 438 aa  343  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  0.538152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>