More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3536 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  61.27 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  61.27 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 213 aa  244  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 204 aa  244  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 204 aa  244  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 194 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 193 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  27.37 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  26.32 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  38.18 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  27.13 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  36.36 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  42.11 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  25.59 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>