154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3411 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  70 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  70.29 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50850  hypothetical protein  67.54 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0823811  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  35.22 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  33.11 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  35.13 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5983  type VI secretion protein  33.97 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  31.44 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  29.69 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  35.13 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  31.16 
 
 		 356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  30.84 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  34.77 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  30.84 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  31.1 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  31.89 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.9 
 
 		 343 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  31.07 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.1 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  30.07 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  29.81 
 
 		 330 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  28.08 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.17 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  28.48 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  28.57 
 
 		 362 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  26.98 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  29.3 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  30.29 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  31.72 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  26.03 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  30.64 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  28.16 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.06 
 
 		 364 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  29.61 
 
 		 367 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  29.02 
 
 		 349 aa  96.3  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.37 
 
 		 370 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  29.02 
 
 		 349 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  28.84 
 
 		 351 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  29.02 
 
 		 349 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  29.02 
 
 		 349 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  30.12 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  30.12 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  30.12 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  30.12 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  30.12 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  30.12 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  30.12 
 
 		 366 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  27.05 
 
 		 360 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.1 
 
 		 385 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  26.95 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.72 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  28.88 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  27.05 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  28.88 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  29.75 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.69 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  29.75 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  29.75 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  30.21 
 
 		 369 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  28.52 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  26.01 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  26.01 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  29.75 
 
 		 361 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  29.75 
 
 		 361 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  29.75 
 
 		 361 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  29.3 
 
 		 338 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  26.87 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000026  hypothetical protein  24.49 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  28.4 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  27.8 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  28.52 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  28.61 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  27.09 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  24.05 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  28.7 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  28.4 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  28.11 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.54 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  28.4 
 
 		 366 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  28.81 
 
 		 427 aa  86.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  28.44 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  26.15 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.57 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.57 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  27.88 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  26.43 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  26.76 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  23.57 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  23.21 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  26.62 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6045  hypothetical protein  28.71 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  26.72 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  26.62 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  29.09 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.77 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.78 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  28.71 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  28.31 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  29.09 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>