140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3408 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  338  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  88.41 
 
 		 165 aa  308  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  88.41 
 
 		 165 aa  308  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  85.98 
 
 		 165 aa  302  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  60.74 
 
 		 161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  60.12 
 
 		 161 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  60.12 
 
 		 161 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  60.12 
 
 		 161 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.963871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  59.51 
 
 		 161 aa  205  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  45.45 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5980  hypothetical protein  44.1 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4839  putative cytoplasmic protein  39.01 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4764  putative cytoplasmic protein  39.01 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4913  hypothetical protein  39.01 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4863  putative cytoplasmic protein  39.01 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.676773  normal  0.639801 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4911  hypothetical protein  38.3 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.125309  normal  0.115148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  33.74 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  33.74 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  33.74 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  34.36 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  33.13 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  33.13 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  33.13 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  31.17 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  31.9 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  31.87 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  31.45 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  30.63 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  30.63 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  30.63 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  31.25 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6054  hypothetical protein  31.87 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932106  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3068  hypothetical protein  33.09 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  27.81 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3642  hypothetical protein  30.46 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3633  hypothetical protein  30.46 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3658  hypothetical protein  30.46 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  32.47 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  33.8 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2175  hypothetical protein  30.54 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000201065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.06 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.26 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.91 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.36 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  31.06 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.56 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  30.91 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  30.91 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2928  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.14 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.19 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2962  hypothetical protein  28.48 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  29.38 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.04 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  28.95 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  28.95 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.47 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.95 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  33.97 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  30.97 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  27.33 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  29.81 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  29.81 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  29.81 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  29.81 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  29.81 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  29.81 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  29.81 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3561  hypothetical protein  27.15 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00586235  normal  0.966398 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2637  hypothetical protein  27.15 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0383  hypothetical protein  27.15 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.211293  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0469  hypothetical protein  27.15 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000529011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0447  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.15 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406517  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0404  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.15 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000425347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  29.03 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  29.59 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.81 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.33 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  28.17 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  28.75 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  28.17 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1537  histidine kinase  31.1 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  31.17 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  25.83 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.12 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3022  hypothetical protein  26.25 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.379437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4915  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.83 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101993  hitchhiker  0.00306602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.37 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  32.69 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  28.12 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  28.03 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.72 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  25.33 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  26.57 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  28.29 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4965  hypothetical protein  29.09 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  26.4 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  26.4 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  26.4 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000028  hemolysin-coregulated protein  28.68 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>