More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3379 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  68.78 
 
 		 224 aa  318  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  69.09 
 
 		 229 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  67.26 
 
 		 224 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  69.12 
 
 		 225 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  69.12 
 
 		 225 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  69.12 
 
 		 225 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4465  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  71.22 
 
 		 206 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0436659 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  68.2 
 
 		 225 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  65.02 
 
 		 224 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0102  two component heavy metal response transcriptional regulator  67.74 
 
 		 223 aa  299  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.753235  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  64.84 
 
 		 223 aa  298  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  67.28 
 
 		 225 aa  298  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  64.38 
 
 		 223 aa  296  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  67.43 
 
 		 226 aa  295  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  65.44 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  66.36 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  64.98 
 
 		 224 aa  292  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  66.36 
 
 		 225 aa  291  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  66.06 
 
 		 226 aa  291  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  61.26 
 
 		 225 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.59 
 
 		 223 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5607  two-component response regulator  65.47 
 
 		 229 aa  287  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.63 
 
 		 226 aa  287  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3603  DNA-binding heavy metal response regulator  61.43 
 
 		 229 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203952  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.13 
 
 		 223 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  61.26 
 
 		 225 aa  286  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  64.84 
 
 		 228 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.78 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3374  heavy metal response regulator  61.43 
 
 		 229 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3722  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  64.98 
 
 		 223 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64570  two-component response regulator  64.57 
 
 		 229 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  64.38 
 
 		 228 aa  284  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  64.13 
 
 		 225 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  63.3 
 
 		 223 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.13 
 
 		 223 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  64.38 
 
 		 228 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.67 
 
 		 223 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.67 
 
 		 223 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  63.01 
 
 		 228 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  63.01 
 
 		 228 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  63.01 
 
 		 228 aa  278  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  64.13 
 
 		 227 aa  278  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  61.78 
 
 		 228 aa  277  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.55 
 
 		 223 aa  277  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.33 
 
 		 230 aa  275  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  62.1 
 
 		 228 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.83 
 
 		 223 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  65.6 
 
 		 226 aa  272  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  61.19 
 
 		 226 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1498  two component heavy metal response transcriptional regulator  64.57 
 
 		 223 aa  272  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.01 
 
 		 219 aa  272  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  63.47 
 
 		 232 aa  272  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.26 
 
 		 225 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.71 
 
 		 225 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.71 
 
 		 225 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.71 
 
 		 225 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  60.37 
 
 		 229 aa  270  9e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.71 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  58.67 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.29 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.26 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.67 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  59.91 
 
 		 229 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  59.91 
 
 		 229 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  59.91 
 
 		 229 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  58.67 
 
 		 230 aa  269  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  59.91 
 
 		 229 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  59.91 
 
 		 229 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  59.91 
 
 		 229 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  59.91 
 
 		 229 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  59.46 
 
 		 227 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  59.46 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.46 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  59.46 
 
 		 227 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.46 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.46 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.46 
 
 		 227 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.46 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00315  probable two component response regulator transcription regulator protein  60.91 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.37 
 
 		 224 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0197  transcriptional activator protein, response regulator  57.33 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0086442  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  59.56 
 
 		 226 aa  268  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  59.63 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2234  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.88 
 
 		 225 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0708  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.91 
 
 		 226 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328024  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.45 
 
 		 227 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.45 
 
 		 227 aa  265  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.45 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.45 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.99 
 
 		 226 aa  264  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.36 
 
 		 226 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  58.56 
 
 		 226 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.66 
 
 		 225 aa  264  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.99 
 
 		 224 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.99 
 
 		 228 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  58.56 
 
 		 226 aa  263  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.36 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.37 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.36 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>