More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3354 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  76.04 
 
 		 220 aa  331  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  76.04 
 
 		 220 aa  331  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  74.43 
 
 		 220 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  75.58 
 
 		 220 aa  328  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.56 
 
 		 219 aa  316  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  70.64 
 
 		 219 aa  315  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  70.51 
 
 		 220 aa  292  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  70.97 
 
 		 220 aa  284  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  62.84 
 
 		 227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  58.8 
 
 		 218 aa  260  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.02 
 
 		 219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  55.5 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.59 
 
 		 220 aa  251  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  55.09 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  56.48 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  55.5 
 
 		 221 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  56.94 
 
 		 220 aa  244  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  56.94 
 
 		 225 aa  244  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  56.94 
 
 		 224 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  55.09 
 
 		 220 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  53.15 
 
 		 232 aa  242  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  56.48 
 
 		 220 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  55.5 
 
 		 221 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  56.48 
 
 		 224 aa  241  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  53.15 
 
 		 223 aa  241  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  55.35 
 
 		 220 aa  241  7.999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  56.02 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  56.02 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  56.02 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  56.02 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  56.02 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.1 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.1 
 
 		 244 aa  236  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  55.61 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  53.21 
 
 		 221 aa  235  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  52.21 
 
 		 235 aa  234  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  55.14 
 
 		 241 aa  234  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.31 
 
 		 224 aa  234  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  55.61 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  51.11 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 242 aa  231  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2538  two component transcriptional regulator  56.1 
 
 		 210 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  52.66 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  52.66 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  50.92 
 
 		 218 aa  228  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  51.85 
 
 		 223 aa  225  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 222 aa  224  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 221 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  52.8 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2624  two component transcriptional regulator  54.46 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  52.07 
 
 		 220 aa  221  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  52.07 
 
 		 220 aa  221  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  52.07 
 
 		 220 aa  221  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.86 
 
 		 219 aa  221  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  51.38 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.4 
 
 		 219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  50.69 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.92 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  51.4 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  50.69 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2066  two component transcriptional regulator QseB  50.46 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.4 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  48.4 
 
 		 219 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  48.4 
 
 		 219 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.4 
 
 		 219 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.4 
 
 		 219 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  49.31 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0139  DNA-binding response regulator  51.83 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.4 
 
 		 219 aa  217  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  51.4 
 
 		 227 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.13 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.13 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.13 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.13 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.13 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  52.78 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  51.83 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  54.17 
 
 		 220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5363  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00637832  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1337  two component transcriptional regulator  52.34 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257065  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3443  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0448196  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  46.58 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4924  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000483234  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3456  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.836579  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2754  two-component system response regulator  53.24 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.864218  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  52.31 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  52.31 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  52.31 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  52.31 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  52.31 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 221 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>