232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3342 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  625  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3031  UspA domain-containing protein  45.21 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3344  hypothetical protein  44.52 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25790  universal stress protein, UspA family  45.39 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3288  universal stress protein  44.77 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2470  UspA domain-containing protein  44.77 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595783  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3347  hypothetical protein  42.95 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1667  universal stress protein family  45.24 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3237  universal stress protein  38.8 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3340  universal stress protein  37.87 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2453  UspA domain-containing protein  38.13 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3156  universal stress protein  37.29 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2558  UspA domain-containing protein  37.29 
 
 		 296 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2890  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2699  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 		 296 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3008  UspA domain-containing protein  33.66 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2745  universal stress protein  33.33 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2468  UspA domain-containing protein  35.09 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51316  normal  0.507158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3029  UspA domain-containing protein  35.07 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3290  universal stress protein  34.34 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  28.43 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  27.06 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  26.47 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  27.69 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  26.4 
 
 		 310 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1851  universal stress protein UspE  26.47 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  25.9 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01310  stress-induced protein  25.82 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2312  UspA domain protein  25.82 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.172993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1980  universal stress protein UspE  25.82 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.420697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01320  hypothetical protein  25.82 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1449  universal stress protein UspE  25.82 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2292  universal stress protein UspE  25.82 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1789  universal stress protein UspE  25.82 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1545  universal stress protein UspE  25.49 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1490  universal stress protein UspE  25.66 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0578551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1784  universal stress protein UspE  25.66 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334213  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1786  universal stress protein UspE  25.66 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  25.08 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1846  universal stress protein UspE  25.66 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3260  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1044  universal stress protein UspE  26.54 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.106711  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3296  universal stress protein  24.84 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  26.9 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02064  universal stress protein UspE  24.6 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00593148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1943  universal stress protein UspE  26.47 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361169  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1832  universal stress protein UspE  26.47 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1863  universal stress protein UspE  25.33 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.809514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1672  universal stress protein UspE  25.33 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0632813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2065  universal stress protein UspE  25.33 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  23.89 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2080  universal stress protein UspE  25.66 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  24.26 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  24.26 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  24.26 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38400  universal stress protein family  29.67 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1572  universal stress protein UspE  26.06 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  24.04 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4897  hypothetical protein  29.47 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2399  universal stress protein UspE  25.49 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  24.27 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2583  universal stress protein UspE  25.32 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  24.27 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  24.27 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2106  universal stress protein UspE  24.34 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  24.27 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  24.27 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  26.05 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  24.18 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56220  hypothetical protein  29.14 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003476  universal stress protein E  27.24 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.181718  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3294  universal stress protein  28.77 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.949607  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2938  universal stress protein  24.92 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  26.03 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0629  UspA domain-containing protein  26.13 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  25.35 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0879  universal stress protein UspE  21.9 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0349688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3393  hypothetical protein  25.59 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2451  UspA domain-containing protein  30.9 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.512934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2103  hypothetical protein  23.61 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0483069  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  31.22 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  28.44 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2765  UspA domain-containing protein  27.73 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000419  universal stress protein family 1  28.04 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2187  universal stress protein  26.27 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1811  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03146  Universal stress protein, UspA  26.77 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747468  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  30.46 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3550  UspA domain-containing protein  26.27 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2576  UspA domain-containing protein  24.26 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140838  hitchhiker  0.00089263 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  34.46 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3514  hypothetical protein  26.24 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1041  UspA domain-containing protein  22.08 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0722  hypothetical protein  26.7 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.483462 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  30.87 
 
 		 144 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.02 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  31.08 
 
 		 144 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  25.16 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1915  UspA domain-containing protein  23.05 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>