More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3272 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 212 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  71.22 
 
 		 202 aa  308  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  65.67 
 
 		 209 aa  284  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  47.39 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  47.87 
 
 		 211 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  34.34 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1616  isochorismatase family protein  27.49 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1100  isochorismatase hydrolase  25.96 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2078  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  31.03 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  33.53 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  31.76 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0874  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  33.9 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  31.18 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  47.56 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.18 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.18 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.18 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  27.05 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  42.68 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  42.68 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  26.9 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  31.98 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.9 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  41.46 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  24.85 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  31.08 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  41.46 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  37.89 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  26.7 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  31.21 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.7 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  26.57 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  32.23 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  27.64 
 
 		 533 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3647  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  29.58 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  32.23 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  32.23 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  27.51 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C36  amidase  25.93 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  25.39 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  33.03 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  31.4 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  36.84 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  24.27 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  24.7 
 
 		 181 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  36.84 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  49.15 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  28.97 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  31.4 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  26.54 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  31.19 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  36.84 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  32.17 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  26.7 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  31.4 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  28.7 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2443  Epoxide hydrolase domain protein  60.38 
 
 		 503 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>