More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3058 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  82.78 
 
 		 210 aa  358  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  82.3 
 
 		 210 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  82.78 
 
 		 215 aa  352  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  80.86 
 
 		 210 aa  351  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  79.9 
 
 		 210 aa  345  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  81.9 
 
 		 219 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 226 aa  95.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  34.35 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  34.23 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  30.57 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0232  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 221 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  27.6 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  28.06 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  28.64 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.8 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  25.12 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  28.26 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 244 aa  62  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
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NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
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NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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