More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2853 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2853  amino acid ABC transporter permease  100 
 
 
292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3517  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  73.65 
 
 
292 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.851369  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1984  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  70.59 
 
 
291 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  70.5 
 
 
297 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6458  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.31 
 
 
297 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2097  ABC transporter permease  65.94 
 
 
285 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.76 
 
 
290 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0200727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2001  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.91 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.11761  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.33 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5577  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.63 
 
 
304 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.89 
 
 
307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1161  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.43 
 
 
319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0329373  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0040  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.14 
 
 
309 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4596  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  48.33 
 
 
304 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1317  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  46.69 
 
 
299 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2933  amino acid ABC transporter, permease protein  46.01 
 
 
332 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.849653  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5222  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.3 
 
 
318 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.162381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2362  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.55 
 
 
305 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3710  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.45 
 
 
365 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.91 
 
 
352 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34670  amino acid ABC transporter membrane protein  47.68 
 
 
374 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220072  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3682  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.97 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.537198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0389  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.31 
 
 
326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7702  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.68 
 
 
333 aa  212  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5407  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.14 
 
 
309 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0928  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.3 
 
 
329 aa  209  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0258353  normal  0.0157714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02270  amino acid ABC transporter membrane protein  40.73 
 
 
369 aa  209  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4319  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.91 
 
 
307 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328241  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5458  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.55 
 
 
307 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0279925  normal  0.357497 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5377  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.74 
 
 
276 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.9196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3582  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.7 
 
 
310 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.797636  normal  0.0345296 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.9 
 
 
290 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2833  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.02 
 
 
308 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7608  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  40.91 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1067  ABC transporter, permease protein  41.76 
 
 
333 aa  199  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.25 
 
 
592 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0935  amino acid ABC transporter permease  39.93 
 
 
331 aa  195  6e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.38791  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0904  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.89 
 
 
246 aa  195  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3687  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.86 
 
 
310 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822244  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1988  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.96 
 
 
316 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0100  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.5 
 
 
318 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.68 
 
 
595 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.3 
 
 
307 aa  188  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3798  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.25 
 
 
349 aa  185  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3767  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.34 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33193  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2891  amino acid ABC transporter permease  39.35 
 
 
329 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0444543  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27180  amino acid ABC transporter membrane protein  43.98 
 
 
322 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.49 
 
 
602 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3033  amino acid ABC transporter permease  43.62 
 
 
307 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.62 
 
 
307 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.253474  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3049  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.62 
 
 
307 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.380934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3010  amino acid ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
324 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.42 
 
 
619 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  41.45 
 
 
598 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.42 
 
 
597 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.61 
 
 
581 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  39.05 
 
 
597 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.05 
 
 
597 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1383  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  40 
 
 
313 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.535175  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.71 
 
 
636 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.71 
 
 
636 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  39.71 
 
 
636 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.71 
 
 
636 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  39.71 
 
 
636 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  39.71 
 
 
636 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.71 
 
 
636 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.28 
 
 
594 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.28 
 
 
595 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.58 
 
 
220 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1927  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  44.98 
 
 
222 aa  160  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.28 
 
 
594 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 
220 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.99 
 
 
226 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.490493  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2087  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.23 
 
 
306 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.51 
 
 
337 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  43.84 
 
 
219 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0724  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.43 
 
 
241 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  42.58 
 
 
228 aa  152  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5602  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.43 
 
 
241 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0522  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.68 
 
 
306 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0639  amino acid ABC transporter, permease protein  44.09 
 
 
226 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  42.72 
 
 
222 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.95 
 
 
217 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 
222 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.71 
 
 
223 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
232 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2588  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.78 
 
 
221 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.64 
 
 
226 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
232 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.35 
 
 
489 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  41.35 
 
 
489 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.35 
 
 
489 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 
209 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 
222 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2493  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.24 
 
 
321 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.761047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  39.91 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  39.91 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  39.91 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>