More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2842 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
340 aa  697    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  83.54 
 
 
337 aa  567  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  74.77 
 
 
339 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  75.08 
 
 
339 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  68.14 
 
 
326 aa  457  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  68.67 
 
 
326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  68.93 
 
 
327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  69.26 
 
 
327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  67.96 
 
 
327 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  67.96 
 
 
327 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  67.96 
 
 
327 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  68.28 
 
 
327 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  67.96 
 
 
327 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  66.24 
 
 
322 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  66.24 
 
 
322 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  66.24 
 
 
322 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  66.24 
 
 
322 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  65.92 
 
 
322 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  67.3 
 
 
327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  66.24 
 
 
322 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  66.24 
 
 
322 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  68.91 
 
 
327 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  66.24 
 
 
322 aa  443  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0925  glycosyl transferase, group 2 family protein  67.09 
 
 
331 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.937263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  66.67 
 
 
327 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  67.3 
 
 
327 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  51.67 
 
 
310 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  50.31 
 
 
341 aa  299  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
340 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  49.69 
 
 
345 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  49.69 
 
 
345 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  49.69 
 
 
345 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  48.92 
 
 
344 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  49.52 
 
 
344 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50 
 
 
335 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  50.32 
 
 
312 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  48.87 
 
 
331 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  48.06 
 
 
332 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.69 
 
 
335 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.69 
 
 
335 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  48.87 
 
 
331 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.69 
 
 
335 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.69 
 
 
335 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  49.69 
 
 
335 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  49.69 
 
 
335 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  49.69 
 
 
335 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  48.1 
 
 
312 aa  289  4e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  49.5 
 
 
312 aa  288  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  49.07 
 
 
350 aa  288  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  48.76 
 
 
347 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4590  Undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  48.39 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00472889  decreased coverage  0.00198336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  47.48 
 
 
349 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  50.33 
 
 
312 aa  278  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  48.06 
 
 
320 aa  275  8e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  46.62 
 
 
320 aa  272  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3976  glycosyl transferase family protein  49.84 
 
 
325 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1411  glycosyl transferase family protein  46.38 
 
 
314 aa  269  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  40.58 
 
 
321 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  40.71 
 
 
314 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  37.22 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  40.38 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  39.12 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  38.68 
 
 
320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
320 aa  209  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
336 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  39.94 
 
 
343 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  39.94 
 
 
343 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  39.16 
 
 
314 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3616  glycosyl transferase family protein  43.09 
 
 
312 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.874932  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 
342 aa  205  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
320 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 
319 aa  203  4e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  39.48 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.87 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  39.08 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  39.55 
 
 
329 aa  199  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 
320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 
337 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  39.35 
 
 
316 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  40.89 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  40.58 
 
 
343 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 
336 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 
336 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  38.91 
 
 
335 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 
319 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 
318 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 
344 aa  186  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.22 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
347 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  35.31 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
334 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
366 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  37.94 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 
364 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>