54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2832 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  366  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  63.54 
 
 
191 aa  219  1e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  48.45 
 
 
176 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  47.13 
 
 
176 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  47.16 
 
 
178 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  37.56 
 
 
207 aa  115  4e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  37.7 
 
 
207 aa  114  8e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  34.62 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  31.25 
 
 
201 aa  79  3e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  31.64 
 
 
240 aa  78.6  5e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  29.3 
 
 
215 aa  78.2  6e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  30.64 
 
 
250 aa  77  1e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  31.14 
 
 
242 aa  76.6  2e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  31.18 
 
 
211 aa  77  2e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  30.05 
 
 
212 aa  75.1  5e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  33.69 
 
 
192 aa  74.7  6e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  30.19 
 
 
243 aa  73.6  1e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  28.92 
 
 
238 aa  73.6  2e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  29.12 
 
 
253 aa  73.2  2e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  28.92 
 
 
239 aa  73.6  2e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  28.18 
 
 
233 aa  72.8  3e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  28.82 
 
 
248 aa  71.6  6e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  28.64 
 
 
222 aa  70.5  1e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  28.31 
 
 
238 aa  69.3  3e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  27.71 
 
 
240 aa  68.9  4e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  28.16 
 
 
222 aa  65.5  5e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  30.69 
 
 
233 aa  64.7  7e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  31.11 
 
 
196 aa  63.2  2e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  30.22 
 
 
239 aa  61.2  7e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  30.22 
 
 
256 aa  61.2  7e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  30.22 
 
 
256 aa  61.2  7e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  30.22 
 
 
256 aa  61.2  7e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  26.9 
 
 
197 aa  61.2  8e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.2506e-07 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  30.22 
 
 
252 aa  61.2  8e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  30.22 
 
 
252 aa  61.2  8e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  28.24 
 
 
203 aa  60.5  1e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  27.71 
 
 
196 aa  60.5  1e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  29.5 
 
 
264 aa  60.1  2e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  29.5 
 
 
252 aa  59.7  2e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  27.75 
 
 
236 aa  59.7  2e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.07973e-05  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  27.61 
 
 
199 aa  57.4  1e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  26.67 
 
 
204 aa  56.6  2e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  26.88 
 
 
198 aa  55.1  6e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  30 
 
 
233 aa  53.9  1e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  25.65 
 
 
201 aa  53.1  2e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  26.67 
 
 
195 aa  51.6  6e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  28.42 
 
 
209 aa  51.2  7e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  25.97 
 
 
207 aa  49.7  2e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  30.47 
 
 
197 aa  49.3  3e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  28.57 
 
 
195 aa  48.1  6e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  26.32 
 
 
188 aa  47.8  9e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  30.21 
 
 
241 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  29.08 
 
 
210 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>