32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2784 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  100 
 
 		 436 aa  860    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  75.41 
 
 		 438 aa  614  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  73.83 
 
 		 430 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  55.84 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  57.11 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  57.35 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  54.13 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  56.13 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  56.13 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  55.12 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  55.71 
 
 		 463 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  48.03 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 448 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  40.8 
 
 		 457 aa  296  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  42.23 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  43.81 
 
 		 450 aa  286  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  43 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  43.36 
 
 		 458 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 449 aa  279  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  41.42 
 
 		 442 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  33.93 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  31.75 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  29.15 
 
 		 939 aa  93.6  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  27.57 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  25 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  58.18 
 
 		 73 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.26 
 
 		 1056 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54110  nucleotide transporter 5  25.23 
 
 		 547 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.779323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  24.06 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  23.14 
 
 		 666 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45145  nucleotide transporter 2  25.25 
 
 		 575 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0739731  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  27.27 
 
 		 610 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>