294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2770 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  83.07 
 
 		 196 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  65.38 
 
 		 199 aa  247  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  63.44 
 
 		 198 aa  241  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  64.09 
 
 		 198 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 189 aa  131  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 204 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  42.61 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  38.17 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  35.96 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  32.42 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 192 aa  94.4  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  87.8  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  30.9 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  30.05 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  35.06 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  36.04 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  29.83 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  38.53 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  37.96 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
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NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
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NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  32.71 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
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NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
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NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_2097  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530578  normal  0.137365 
 
 
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