More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2529 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
487 aa  999  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  78.25 
 
 
471 aa  762  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  88.91 
 
 
469 aa  844  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  88.49 
 
 
469 aa  839  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  78.04 
 
 
500 aa  760  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  88.27 
 
 
469 aa  837  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  68.79 
 
 
472 aa  671  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  71.89 
 
 
491 aa  699  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  86.78 
 
 
469 aa  850  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  62.71 
 
 
482 aa  603  1e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  60 
 
 
477 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  60.08 
 
 
471 aa  584  1e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  60.43 
 
 
471 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  58.74 
 
 
481 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  58.99 
 
 
473 aa  575  1e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  58.85 
 
 
473 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  57.48 
 
 
477 aa  562  1e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  57.78 
 
 
477 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  57.78 
 
 
477 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  58 
 
 
477 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  57.26 
 
 
477 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  57.78 
 
 
477 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  57.05 
 
 
484 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  57.51 
 
 
483 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.67 
 
 
470 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  57.08 
 
 
470 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  60.3 
 
 
476 aa  555  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  56.87 
 
 
470 aa  545  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  57.76 
 
 
483 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  56.65 
 
 
483 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  55.63 
 
 
489 aa  537  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  57.11 
 
 
481 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  55.19 
 
 
493 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  55.19 
 
 
493 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  55.19 
 
 
493 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  55.19 
 
 
493 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  55.19 
 
 
491 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1569  GntR family transcriptional regulator  55.39 
 
 
491 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180299  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1437  GntR family transcriptional regulator  55.26 
 
 
494 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  52.67 
 
 
472 aa  508  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  54.19 
 
 
473 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  54.24 
 
 
479 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  54.03 
 
 
478 aa  507  1e-142  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  54.04 
 
 
478 aa  507  1e-142  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  54.04 
 
 
478 aa  507  1e-142  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  49.79 
 
 
473 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  50.11 
 
 
532 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  48.54 
 
 
477 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5785  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.68 
 
 
483 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6902  transcriptional regulator  52.35 
 
 
488 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78999  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  49.79 
 
 
478 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.12 
 
 
477 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  49.57 
 
 
473 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  49.26 
 
 
483 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  49.79 
 
 
473 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.09 
 
 
483 aa  475  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
472 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  49.36 
 
 
473 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
472 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
472 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
472 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
472 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
472 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  47.55 
 
 
475 aa  470  1e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  50.11 
 
 
493 aa  471  1e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  52.69 
 
 
482 aa  468  1e-130  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 
473 aa  466  1e-130  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  49.36 
 
 
474 aa  467  1e-130  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  49.57 
 
 
473 aa  466  1e-130  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  49.36 
 
 
478 aa  465  1e-130  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  47.55 
 
 
475 aa  465  1e-130  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.33 
 
 
472 aa  466  1e-130  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2231  GntR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
433 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4500  GntR family transcriptional regulator  52.03 
 
 
472 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.705718  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  48.72 
 
 
474 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2521  aminotransferase  51.06 
 
 
433 aa  463  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
474 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5025  transcriptional regulator  52.24 
 
 
472 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  48.2 
 
 
475 aa  461  1e-128  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
474 aa  461  1e-128  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  48.3 
 
 
474 aa  459  1e-128  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  48.72 
 
 
474 aa  461  1e-128  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  48.19 
 
 
474 aa  460  1e-128  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
474 aa  461  1e-128  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  47.99 
 
 
475 aa  458  1e-128  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  47.99 
 
 
474 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  47.99 
 
 
474 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  48.3 
 
 
474 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  48.3 
 
 
474 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  47.99 
 
 
474 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
479 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.35 
 
 
473 aa  454  1e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.48 
 
 
475 aa  453  1e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
470 aa  454  1e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  47.97 
 
 
468 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  6.34797e-11 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.18 
 
 
468 aa  451  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  48.18 
 
 
468 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  48.18 
 
 
468 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  5.83102e-14 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  48.18 
 
 
468 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  48.18 
 
 
468 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>