142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2494 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 		 464 aa  968    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  79.86 
 
 		 442 aa  750    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  81.03 
 
 		 464 aa  776    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  43.47 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  41.76 
 
 		 469 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  37.65 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  40.6 
 
 		 440 aa  292  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  37.78 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  37.93 
 
 		 437 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  38.5 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  38.03 
 
 		 438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  37.7 
 
 		 437 aa  282  9e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  37.93 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  37.93 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  37.93 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  37.47 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  37.93 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  37.93 
 
 		 437 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  37.47 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  38.53 
 
 		 466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  35.75 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  36.83 
 
 		 470 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  35.43 
 
 		 432 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  36.92 
 
 		 437 aa  259  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.92 
 
 		 409 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  36.47 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  36.32 
 
 		 424 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  34.09 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  34.43 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  33.64 
 
 		 447 aa  240  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  32.02 
 
 		 434 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  36.08 
 
 		 417 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  33.65 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  33.64 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  31.87 
 
 		 486 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  35.08 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  35.13 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  33.26 
 
 		 433 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  33.1 
 
 		 423 aa  233  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  32.56 
 
 		 425 aa  232  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  34.02 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  33.64 
 
 		 437 aa  226  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  32.32 
 
 		 411 aa  223  7e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  33.8 
 
 		 439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  32.49 
 
 		 415 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  31.54 
 
 		 436 aa  216  9e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  31.8 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  31.72 
 
 		 475 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  31.8 
 
 		 415 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.4 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  31.46 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  30.38 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  30.45 
 
 		 478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  29.16 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.65 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.8 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.36 
 
 		 429 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  27.83 
 
 		 418 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  26.05 
 
 		 437 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.91 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  26.64 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  25.89 
 
 		 446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  24.84 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  24.83 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  29.44 
 
 		 556 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  26.71 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  26.35 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  26.02 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  24.36 
 
 		 413 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  23.77 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  22.95 
 
 		 574 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  26.88 
 
 		 424 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  22.96 
 
 		 642 aa  90.1  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  26.29 
 
 		 572 aa  84.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  26.91 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.48 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  33.96 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  22.5 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  22 
 
 		 444 aa  57  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.36 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  20.05 
 
 		 468 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  24.65 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  28.05 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  23.3 
 
 		 366 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  21.94 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  21.94 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  23.81 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  28.19 
 
 		 539 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  36.23 
 
 		 69 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  23.81 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  18.69 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  22.83 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  20.99 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  26 
 
 		 353 aa  50.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  27.84 
 
 		 466 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  21.93 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  19.07 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  24.6 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.94 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>