More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2489 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
145 aa  293  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  87.5 
 
 
145 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  86.11 
 
 
145 aa  263  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  86.11 
 
 
145 aa  263  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  85.42 
 
 
145 aa  261  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  86.81 
 
 
145 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  81.94 
 
 
145 aa  249  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  81.25 
 
 
164 aa  244  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  67.13 
 
 
154 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  66.43 
 
 
150 aa  193  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  66.43 
 
 
150 aa  193  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  61.81 
 
 
145 aa  184  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  60.56 
 
 
144 aa  181  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  58.74 
 
 
161 aa  177  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 
163 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  66.43 
 
 
154 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  58.74 
 
 
162 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  58.74 
 
 
162 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  60.14 
 
 
162 aa  173  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 
163 aa  173  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 
163 aa  173  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  58.74 
 
 
162 aa  173  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  55.94 
 
 
149 aa  168  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  55.94 
 
 
149 aa  168  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  55.94 
 
 
149 aa  168  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  56.83 
 
 
153 aa  166  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0434  transcriptional regulator, AsnC family  63.93 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 
163 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 
163 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 
163 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  60.33 
 
 
163 aa  157  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  50.69 
 
 
153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  43.17 
 
 
173 aa  133  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  42.45 
 
 
167 aa  131  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
162 aa  120  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
160 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 
165 aa  114  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.14 
 
 
162 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
150 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 
170 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 
153 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  36.43 
 
 
155 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 
170 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 
170 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
153 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
160 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
153 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  37.86 
 
 
151 aa  98.6  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  35.38 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
157 aa  94  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  42.19 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  39.84 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
151 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  33.83 
 
 
157 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  33.58 
 
 
152 aa  91.3  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  34.07 
 
 
164 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  34.07 
 
 
164 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 
158 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  42.19 
 
 
160 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
150 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  35.38 
 
 
150 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  35.38 
 
 
150 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
171 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  35.38 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
171 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
150 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
150 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  35.88 
 
 
147 aa  87.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 
155 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 
155 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 
174 aa  85.9  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 
174 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>