More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2312 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 412 aa  852    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  67.65 
 
 		 416 aa  586  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  66.01 
 
 		 454 aa  569  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  64.95 
 
 		 438 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 415 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 415 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 415 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 415 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 415 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 415 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 415 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  63.24 
 
 		 415 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 415 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  64.46 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  64.79 
 
 		 416 aa  551  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 415 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  64.46 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  64.46 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  64.46 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  64.71 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  64.46 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  63.24 
 
 		 415 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 415 aa  547  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 415 aa  544  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 415 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2165  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 414 aa  544  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.675395  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 430 aa  542  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  63.99 
 
 		 419 aa  542  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 422 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 417 aa  538  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 415 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 		 418 aa  537  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  63.57 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  63.24 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 436 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 		 414 aa  535  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 		 420 aa  537  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2044  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2907  serine hydroxymethyltransferase  61.92 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.0486853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1660  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2874  serine hydroxymethyltransferase  63.14 
 
 		 414 aa  534  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 416 aa  529  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  60.69 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2658  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 		 414 aa  528  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0261213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  60.93 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 508 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 		 419 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  63.33 
 
 		 416 aa  531  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.93 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3100  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 		 414 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 418 aa  527  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0615  Glycine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 415 aa  528  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  524  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0318  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 418 aa  525  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2992  serine hydroxymethyltransferase  62.16 
 
 		 414 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  0.346056 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  60.88 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  60.88 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 410 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 410 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  60.88 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 412 aa  519  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4955  glycine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 430 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 412 aa  519  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  57.6 
 
 		 412 aa  518  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 421 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>