47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2199 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2199  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3789  hypothetical protein  81.95 
 
 
266 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1689  hypothetical protein  81.58 
 
 
266 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2940  hypothetical protein  80.38 
 
 
267 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231953  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2016  hypothetical protein  78.49 
 
 
276 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1576  hypothetical protein  77.74 
 
 
265 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967103  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1548  hypothetical protein  78.49 
 
 
276 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3726  hypothetical protein  78.49 
 
 
276 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2054  hypothetical protein  76.32 
 
 
277 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0469689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24260  hypothetical protein  75.94 
 
 
266 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13545  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18720  hypothetical protein  73 
 
 
275 aa  417  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0277254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1311  hypothetical protein  57.75 
 
 
286 aa  321  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4399  hypothetical protein  56.09 
 
 
283 aa  320  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2166  hypothetical protein  55.85 
 
 
274 aa  319  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2068  hypothetical protein  56.86 
 
 
278 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0821949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1689  hypothetical protein  54.75 
 
 
273 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3170  hypothetical protein  54.17 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0508487  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02030  hypothetical protein  52.08 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1499  hypothetical protein  53.79 
 
 
284 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000002161  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003741  hypothetical protein  52.47 
 
 
274 aa  301  9e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.439263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1398  hypothetical protein  52.99 
 
 
265 aa  298  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2752  hypothetical protein  54.14 
 
 
272 aa  298  9e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2586  hypothetical protein  53.79 
 
 
273 aa  295  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2564  hypothetical protein  52.65 
 
 
274 aa  289  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2631  hypothetical protein  52.65 
 
 
274 aa  288  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2822  hypothetical protein  52.12 
 
 
273 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000140103  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2738  hypothetical protein  52.65 
 
 
274 aa  287  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1529  hypothetical protein  51.74 
 
 
273 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1562  hypothetical protein  51.74 
 
 
273 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0658  hypothetical protein  50.76 
 
 
275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1432  hypothetical protein  51.52 
 
 
274 aa  285  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1718  hypothetical protein  51.14 
 
 
274 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1533  hypothetical protein  51.35 
 
 
273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1355  hypothetical protein  50.78 
 
 
272 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01647  hypothetical protein  51.94 
 
 
279 aa  278  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3440  hypothetical protein  50.39 
 
 
280 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0705  hypothetical protein  43.65 
 
 
274 aa  244  8e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000381885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1473  hypothetical cytosolic protein  43.65 
 
 
274 aa  244  8e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00660  hypothetical protein  41.6 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.26692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1714  hypothetical protein  39.1 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1721  hypothetical protein  35.61 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0366  hypothetical protein  36.69 
 
 
263 aa  163  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0036321  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2784  hypothetical protein  22.73 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1050  hypothetical protein  25.77 
 
 
238 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3210  hypothetical protein  26.88 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1287  hypothetical protein  28.65 
 
 
250 aa  48.9  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2324  hypothetical protein  24.02 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.580961  normal  0.646475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>