275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2163 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2163  ThiJ/PfpI  100 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.843992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7335  hypothetical protein  38.79 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4585  ThiJ/PfpI domain protein  34.04 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.034255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.64 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.94 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1157  ThiJ/PfpI domain protein  31.97 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22600  putative intracellular protease/amidase  28.21 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  30.56 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  31.94 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  26.92 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.93 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  30.14 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2231  intracellular protease, PfpI family  30 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  25.19 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1679  ThiJ/PfpI domain protein  29.34 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4094  ThiJ/PfpI  29.86 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4272  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.86 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.86 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2941  PfpI family intracellular peptidase  28.57 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161732  normal  0.711333 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  29.02 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1373  intracellular protease, PfpI family  36.36 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228619  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3900  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.5 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.47 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1143  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.16 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.505852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3754  intracellular protease, PfpI family  30.6 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  32.03 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06810  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01210)  29.93 
 
 		 933 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.977304  normal  0.681153 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00030  cysteine-type peptidase, putative  28.25 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.329282  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2725  ThiJ/PfpI domain protein  29.75 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.693547 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  26.34 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2009  intracellular protease, PfpI family  31.1 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  28.47 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.23 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2768  peptidase C56, PfpI  27.23 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.731616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0930  peptidase C56, PfpI  30.12 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0223631  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0349  intracellular protease, PfpI family  29.94 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0310  peptidase C56, PfpI  28 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.38 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3932  PfpI family intracellular peptidase  31.52 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.44 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  27.16 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3280  intracellular protease, PfpI family  30.91 
 
 		 193 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94363  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  30.06 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0998  PfpI family intracellular peptidase  29.7 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.16 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.58 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.15 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  25.32 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0271  intracellular protease, PfpI family  27.23 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  28.47 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  24.26 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  24.77 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  27.62 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  29.86 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl402  putative PFPI-like cystiene protease  21.13 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  29.86 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  28.47 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  29.86 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0298  intracellular protease, PfpI family  27.23 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  26.36 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  26.67 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  29.86 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3866  PfpI family intracellular peptidase  29.7 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  29.86 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  29.86 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  25.61 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  29.86 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0958  ThiJ/PfpI domain protein  26.92 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  29.17 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.11 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.15 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.14 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  29.17 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1905  ThiJ/PfpI domain protein  27.37 
 
 		 521 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1197  ThiJ/PfpI family protein  27.23 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1159  ThiJ/PfpI family protein  27.23 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  27.85 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  32.93 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1929  ThiJ/PfpI domain protein  27.37 
 
 		 527 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.15 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  27.52 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  25.53 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  24.15 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1852  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.94 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3696  putative intracellular protease  30.3 
 
 		 189 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.543316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.71 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  26.86 
 
 		 193 aa  52.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  27.78 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0362  peptidase C56, PfpI  26.5 
 
 		 192 aa  52  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5033  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.03 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1929  ThiJ/PfpI domain protein  25.64 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  32.58 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  28.57 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1630  PfpI family intracellular peptidase  27.61 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  28.97 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1145  PfpI family intracellular peptidase  39.02 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.21 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>