More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2100 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2240  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  75.98 
 
 
537 aa  788    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2100  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
537 aa  1070    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.517374  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  43.31 
 
 
535 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
544 aa  243  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2644  chemotaxis transducer  47.5 
 
 
280 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.68 
 
 
547 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2188  histidine kinase  42.77 
 
 
540 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.035953  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
542 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.15 
 
 
540 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 
540 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 
540 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0686  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.07 
 
 
551 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  32.77 
 
 
541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
671 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 
544 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 
547 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 
539 aa  196  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 
674 aa  194  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.41 
 
 
540 aa  193  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.12 
 
 
646 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  32.16 
 
 
544 aa  190  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  35.85 
 
 
392 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 
543 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.11 
 
 
557 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.27 
 
 
544 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.25 
 
 
549 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 
624 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 
637 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.8 
 
 
547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  36.02 
 
 
541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  33.98 
 
 
541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 
545 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.16 
 
 
546 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0674  PAS  41.64 
 
 
544 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.29 
 
 
570 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 
666 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 
601 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 
544 aa  183  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1363  PAS  41.48 
 
 
544 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.31 
 
 
584 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  37.57 
 
 
549 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.26 
 
 
547 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  35.99 
 
 
541 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  36.08 
 
 
543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.61 
 
 
830 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 
628 aa  181  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 
544 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  34.35 
 
 
541 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.56 
 
 
392 aa  179  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.39 
 
 
650 aa  179  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  35.33 
 
 
541 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  37.68 
 
 
549 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  33.83 
 
 
541 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.67 
 
 
542 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 
661 aa  178  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  37.58 
 
 
549 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.87 
 
 
544 aa  177  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116754  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 
640 aa  177  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.64 
 
 
660 aa  177  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.02 
 
 
541 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 
425 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
541 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  37.79 
 
 
533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.17 
 
 
543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0365  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.92 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  32.36 
 
 
541 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2933  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 
540 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.3489100000000001e-18  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 
541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.59 
 
 
540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  35.56 
 
 
633 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.24 
 
 
570 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  34.41 
 
 
541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003886  methyl-accepting chemotaxis protein  29.86 
 
 
542 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 
541 aa  173  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1539  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
626 aa  173  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206608  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.83 
 
 
640 aa  173  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.27 
 
 
535 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35 
 
 
619 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3579  chemotaxis sensory transducer  29.77 
 
 
554 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1243  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.71 
 
 
667 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2016  methyl-accepting chemotaxis protein  33.54 
 
 
433 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000104003  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  34.91 
 
 
674 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 
423 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
658 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.71 
 
 
667 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00146838  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 
667 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
541 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  29.82 
 
 
549 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.83 
 
 
541 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00762848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.21 
 
 
541 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00226615  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.21 
 
 
541 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000214454  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  36.65 
 
 
658 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  35.85 
 
 
640 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2643  methyl-accepting chemotaxis protein  38.82 
 
 
255 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 
535 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  37.09 
 
 
541 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  37.54 
 
 
658 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.68 
 
 
568 aa  171  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 
674 aa  171  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>