More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2050 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  86.17 
 
 		 413 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  88.48 
 
 		 413 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  100 
 
 		 409 aa  823    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  74.93 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  39.95 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  41.67 
 
 		 412 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  40.05 
 
 		 415 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  40.25 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  40.69 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  38.26 
 
 		 418 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  38.59 
 
 		 428 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  38.85 
 
 		 436 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  39.4 
 
 		 438 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  39.02 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  37.09 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  37.34 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  37.98 
 
 		 424 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  37.78 
 
 		 416 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  37.4 
 
 		 385 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  34.11 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  36.68 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  34.03 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  36.04 
 
 		 383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  35.37 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  32.07 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.76 
 
 		 394 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  34.74 
 
 		 378 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  32.2 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  32.37 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  31.23 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.79 
 
 		 376 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  31.94 
 
 		 374 aa  177  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  34.85 
 
 		 389 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  33.78 
 
 		 388 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  33.78 
 
 		 388 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  34.65 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  34.67 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  36.72 
 
 		 375 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  28.61 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  34.59 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.33 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  28.86 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.34 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.34 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  34.87 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  31.25 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  33.99 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  30.71 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  34.13 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  30.98 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  30.98 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  30.65 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  30.58 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  30 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  30 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  29.81 
 
 		 376 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  33.66 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  29.64 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  30.43 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  29.31 
 
 		 424 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  31.04 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  30.42 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.52 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  31.86 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  32.38 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  28.92 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.83 
 
 		 363 aa  135  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  29.1 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  30.63 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  27.91 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  33.54 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  31.03 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  28.16 
 
 		 423 aa  126  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  28.53 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  30.55 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  27.82 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  29.02 
 
 		 434 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0219  peptidase dimerization domain protein  31.82 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176401  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  25.94 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  28.09 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  26.93 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  28.03 
 
 		 368 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  27.59 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  27.23 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  27.42 
 
 		 372 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  27.03 
 
 		 441 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.39 
 
 		 395 aa  86.3  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  28.27 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  28.27 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  28.27 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  28.27 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  28.08 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  28.27 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  27.63 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  28.27 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  27.63 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  26.84 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  27.82 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  29.86 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  28.49 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>