102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2034 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2034  VanW  100 
 
 		 290 aa  596  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54600  hypothetical protein  70.63 
 
 		 273 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0220314  normal  0.0306544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4771  hypothetical protein  70.63 
 
 		 273 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5507  VanW family protein  45.45 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.170032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2239  vancomycin B-type resistance protein VanW  45.06 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00319629  hitchhiker  0.00000191747 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3002  vancomycin B-type resistance protein VanW  44.4 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0598  VanW family protein  40.5 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1773  VanW family protein  41.34 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11841  hypothetical protein  43.78 
 
 		 270 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_002950  PG0532  hypothetical protein  44.33 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1663  VanW family protein  30.08 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  36.43 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  35.38 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  35.38 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  35.38 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  35.38 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  35.38 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  35.38 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  35.38 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  35.38 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  35.38 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  35.38 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  32.34 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  29.75 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  35.34 
 
 		 456 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  29.65 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  34.75 
 
 		 569 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  34.68 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  35.11 
 
 		 781 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  28.07 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  39.34 
 
 		 600 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  34.13 
 
 		 591 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  33.86 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  33.85 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  31.72 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  31.37 
 
 		 467 aa  72.4  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  27.44 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0832  VanW family protein  35.71 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  33.86 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  34.51 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  32.56 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  28.9 
 
 		 686 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  26.23 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  34.81 
 
 		 633 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  28.66 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  28.66 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  28.66 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  28.66 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  28.66 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  28.05 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  32.26 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  28.05 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  29.14 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  29.14 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  31.58 
 
 		 594 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  34.45 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  36.97 
 
 		 677 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  32.48 
 
 		 420 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  28.99 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  30.97 
 
 		 458 aa  62.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  32.11 
 
 		 439 aa  62.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  32.48 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  30.13 
 
 		 636 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  30 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  33.33 
 
 		 580 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  24.31 
 
 		 518 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  34.62 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0964  hypothetical protein  35.14 
 
 		 419 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  27.94 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  30.92 
 
 		 670 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  24.31 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  31.36 
 
 		 576 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  29.41 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  30.92 
 
 		 675 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  37.5 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  26.29 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  29.69 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  30.25 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  29.41 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  27.73 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  31.53 
 
 		 417 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  34.74 
 
 		 450 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  31.62 
 
 		 591 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  30.63 
 
 		 682 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  28.44 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  24.26 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  29.57 
 
 		 748 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  28.33 
 
 		 620 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  32.18 
 
 		 765 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  29.2 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  29.09 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  30.59 
 
 		 455 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  30.16 
 
 		 550 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  26.55 
 
 		 559 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  28.21 
 
 		 580 aa  45.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  27.19 
 
 		 567 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  28.83 
 
 		 847 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  27.59 
 
 		 738 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  26.67 
 
 		 604 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  26.96 
 
 		 569 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>