50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1996 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  100 
 
 		 483 aa  938    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  57.35 
 
 		 498 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  57.14 
 
 		 481 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  56.94 
 
 		 481 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  32.57 
 
 		 627 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  27.22 
 
 		 552 aa  90.5  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  27.4 
 
 		 564 aa  87  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  30.54 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  31.21 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  27.62 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  31.34 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  27.49 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  28.42 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  29.2 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  28.64 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  25 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  28.5 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  28.88 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  32.42 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  25 
 
 		 496 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  25 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  24.73 
 
 		 496 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  29.14 
 
 		 578 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  24.47 
 
 		 502 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  31.1 
 
 		 415 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  28.01 
 
 		 502 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  28.84 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  31.58 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  34.56 
 
 		 170 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  34.33 
 
 		 183 aa  47  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  30.09 
 
 		 245 aa  47  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0032  hypothetical protein  33.77 
 
 		 214 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0801235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  31.25 
 
 		 178 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  33.61 
 
 		 151 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  37.63 
 
 		 154 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  32.77 
 
 		 151 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  32.77 
 
 		 151 aa  43.9  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  32.77 
 
 		 151 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.361683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  32.77 
 
 		 151 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  32.77 
 
 		 151 aa  43.9  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  32.77 
 
 		 160 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  32.77 
 
 		 160 aa  43.9  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  40.26 
 
 		 151 aa  43.9  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  32.77 
 
 		 151 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  32.77 
 
 		 151 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  32.77 
 
 		 151 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  32.77 
 
 		 151 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  34.41 
 
 		 139 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  34.41 
 
 		 139 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>