More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1977 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 216 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  66.2 
 
 		 218 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  64.38 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  64.38 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  63.93 
 
 		 218 aa  274  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  41.51 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 		 425 aa  137  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  41.76 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 327 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 327 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  36.87 
 
 		 327 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  34.9 
 
 		 363 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  34.52 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  32.95 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  33.51 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  36.48 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  31.64 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  31.02 
 
 		 356 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 		 340 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  30.57 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  30.57 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  30.57 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  29.51 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  30.86 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  33.87 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  28.14 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  34.21 
 
 		 217 aa  88.6  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  33.59 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  33.91 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  37.19 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1066  hypothetical protein  28 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.032179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  34.01 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  30.14 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  38.78 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  28.5 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  26.54 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  25.85 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  25.85 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  25.85 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  31.36 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  25.85 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  25.85 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  33.05 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  25.85 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  25.85 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  28.99 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  35.19 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  30.48 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  29.81 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  32.99 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  34.58 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  29.53 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  29.49 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  28.93 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  33.68 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  25.95 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  36.63 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  34.86 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  32.89 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  33.05 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  30.87 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  32.06 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  32.06 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  27.04 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  33.98 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  37.08 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  32.06 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  32.06 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  32.06 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  32.06 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  27.22 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  32.06 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  32.06 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  31.54 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  26.79 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  32.08 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  31.3 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  30.92 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  34.95 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  29.94 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  31.06 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  31.06 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  34.02 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  29.94 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  37.86 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  37.86 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  25.79 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  31.16 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>