More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1783 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  87.1 
 
 		 411 aa  658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  86.1 
 
 		 403 aa  677    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  87.59 
 
 		 403 aa  698    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  85.61 
 
 		 403 aa  667    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  100 
 
 		 403 aa  792    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  86.35 
 
 		 403 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  87.1 
 
 		 403 aa  658    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  84.62 
 
 		 403 aa  638    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  82.88 
 
 		 403 aa  629  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  83.13 
 
 		 403 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  82.63 
 
 		 403 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  69.23 
 
 		 403 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  65.17 
 
 		 404 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  65.67 
 
 		 404 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  65.01 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  61.54 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  61.27 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  61.46 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  62.18 
 
 		 414 aa  441  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  57.65 
 
 		 423 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  49.53 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  50.25 
 
 		 412 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 400 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  43.69 
 
 		 418 aa  296  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 403 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 416 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 418 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  43.11 
 
 		 439 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 421 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 419 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  41.84 
 
 		 433 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 421 aa  249  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  35.93 
 
 		 467 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  35.93 
 
 		 467 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  35.93 
 
 		 467 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  35.93 
 
 		 467 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1222  nitrate transporter, putative  35.93 
 
 		 606 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3401  major facilitator family transporter  36.07 
 
 		 468 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  34.98 
 
 		 455 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3435  major facilitator family transporter  35.84 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3437  nitrate transporter  36.07 
 
 		 1046 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293484  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  31.81 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 420 aa  176  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  30.29 
 
 		 436 aa  176  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  31.08 
 
 		 435 aa  176  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 421 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 440 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  31.31 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  34.79 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  31.1 
 
 		 426 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  31.55 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  31.55 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  29.8 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  29.8 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  29.8 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  29.8 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  29.8 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  29.8 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  29.8 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  29.8 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  35.6 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  34.25 
 
 		 424 aa  163  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 399 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 425 aa  163  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  35.43 
 
 		 424 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  35.43 
 
 		 424 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  34.39 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 403 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 395 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 428 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 389 aa  159  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 389 aa  159  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  29.95 
 
 		 895 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  28.49 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  36.07 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  34.41 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  31.41 
 
 		 905 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  35.71 
 
 		 431 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  30.98 
 
 		 912 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>