More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1777 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  91.01 
 
 		 344 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  100 
 
 		 344 aa  703    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  88.41 
 
 		 344 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  85.47 
 
 		 344 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  85.47 
 
 		 344 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  84.88 
 
 		 344 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  77.75 
 
 		 345 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  67.71 
 
 		 350 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  67.71 
 
 		 350 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  67.61 
 
 		 351 aa  461  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  63.79 
 
 		 327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  81.9 
 
 		 210 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  40.65 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  42.23 
 
 		 403 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  37.19 
 
 		 394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  37.13 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  36.25 
 
 		 392 aa  175  8e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  33.82 
 
 		 401 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  55.03 
 
 		 429 aa  170  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  34.98 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  53.69 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  39.51 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  33.14 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  35.57 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  43.81 
 
 		 337 aa  159  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  30.72 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  54.36 
 
 		 375 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  30.31 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  28.78 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  31.44 
 
 		 368 aa  149  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 		 468 aa  149  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  33.58 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  35.41 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  49.66 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  44.1 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  36.96 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  31.54 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  29.52 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  31.88 
 
 		 459 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  45.33 
 
 		 209 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  35.83 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  29.5 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  31.14 
 
 		 466 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  30.26 
 
 		 454 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  30.75 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  29.82 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  33.22 
 
 		 367 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  32.7 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  37.9 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  32.03 
 
 		 363 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 375 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  45.12 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  47.65 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  35.85 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  35.85 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  46.04 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 		 372 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  35.55 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  41.06 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  37.1 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  32.03 
 
 		 366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  33.21 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.58 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  45.62 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  34.44 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  43.42 
 
 		 373 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  50.96 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  28.61 
 
 		 388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  42.76 
 
 		 201 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  46.79 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  45.81 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  48.05 
 
 		 231 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  50 
 
 		 218 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  41.22 
 
 		 201 aa  116  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  42.5 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  54.29 
 
 		 223 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  39.73 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  43.23 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  44.38 
 
 		 239 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  38.36 
 
 		 202 aa  113  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  34.13 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  40.41 
 
 		 202 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  40.41 
 
 		 202 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  40.41 
 
 		 202 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  41.88 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 		 434 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  39.73 
 
 		 202 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  50.48 
 
 		 260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  39.73 
 
 		 185 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 242 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  39.57 
 
 		 240 aa  109  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 230 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  47.46 
 
 		 229 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>