57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1771 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  100 
 
 
329 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  75.08 
 
 
329 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  77.19 
 
 
342 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  73.98 
 
 
330 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  73.27 
 
 
330 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  74.53 
 
 
342 aa  487  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  73.58 
 
 
342 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  68.39 
 
 
329 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  65.41 
 
 
336 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  65.3 
 
 
336 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
319 aa  96.7  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  25.09 
 
 
302 aa  96.3  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  26.64 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  25.18 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  24.82 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  28.62 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
357 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.94 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  28.95 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.37 
 
 
1132 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  28.93 
 
 
1152 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.25 
 
 
1152 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
275 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  25.82 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  25 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  21.59 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  27.82 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0629  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1997  AB-hydrolase associated lipase region  30.48 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140936  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 
272 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
268 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  25.8 
 
 
473 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
248 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
315 aa  43.1  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2455  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  28.57 
 
 
530 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>