More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1752 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  71.05 
 
 		 229 aa  331  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5452  HAD-superfamily hydrolase  72.99 
 
 		 212 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  49.11 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  46.08 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18961  phosphatase/phosphohexomutase  37.31 
 
 		 225 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.452816 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09497  HAD superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10760)  35.4 
 
 		 296 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59029  predicted protein  37.31 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  38.43 
 
 		 217 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  33.74 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06771  phosphatase/phosphohexomutase  35.16 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04170  conserved hypothetical protein  38.17 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.73 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0056  HAD family hydrolase  35.96 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 396 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.69 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  33.82 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  38.28 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.32 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  37.8 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1319  HAD family hydrolase  41.98 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.73 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  35.64 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  30.7 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  35.64 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2733  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  36.32 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.53567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  34.2 
 
 		 188 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.5 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  30.88 
 
 		 217 aa  98.6  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  37.24 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.75 
 
 		 217 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.69 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  36 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  36.18 
 
 		 271 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  38.54 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  36.13 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  39.79 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 		 256 aa  95.9  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.97 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1138  HAD family hydrolase  36.31 
 
 		 216 aa  95.9  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  35.86 
 
 		 188 aa  95.9  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.27 
 
 		 223 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  30.39 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.81 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15581  phosphatase/phosphohexomutase  32.42 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0792  beta-phosphoglucomutase  33.66 
 
 		 215 aa  95.1  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  31.43 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.68 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.2 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.45 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  34.55 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  31.73 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  36.6 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  32.16 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  37.31 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.72 
 
 		 217 aa  92  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  32.86 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  28.64 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.23 
 
 		 213 aa  91.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  34.74 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  32.02 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.04 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  39.18 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  35.2 
 
 		 188 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  33.78 
 
 		 728 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  32.84 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  32.64 
 
 		 188 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.16 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  36.55 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  34.69 
 
 		 188 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  32.83 
 
 		 188 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  36.68 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.33 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27350  HAD-superfamily hydrolase  35.85 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.85 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  34.69 
 
 		 269 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.65 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  34.69 
 
 		 188 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  34.69 
 
 		 188 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.63 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.67 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.61 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  32.99 
 
 		 188 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  32.99 
 
 		 188 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  32.99 
 
 		 188 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29210  predicted protein  37.96 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.051263  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  30.92 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  33.16 
 
 		 188 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1824  HAD family hydrolase  35.09 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  33.16 
 
 		 188 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  33.84 
 
 		 188 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  33.16 
 
 		 188 aa  87  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>