More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1527 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  100 
 
 
283 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  73.5 
 
 
282 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  71.02 
 
 
282 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  71.02 
 
 
283 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  64.08 
 
 
284 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  55.63 
 
 
279 aa  279  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  53.36 
 
 
279 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  52.33 
 
 
278 aa  268  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  51.24 
 
 
283 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  54.14 
 
 
285 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  50.18 
 
 
276 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  50.34 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  50.51 
 
 
294 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  52.4 
 
 
290 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  53.33 
 
 
280 aa  252  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  51.22 
 
 
287 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  52.13 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  52.13 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  51.77 
 
 
272 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  51.77 
 
 
272 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  52.98 
 
 
272 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  49.83 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  51.58 
 
 
273 aa  238  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  51.77 
 
 
271 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  51.77 
 
 
271 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  51.06 
 
 
271 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  51.06 
 
 
271 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  49.3 
 
 
276 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  52.11 
 
 
272 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  48.41 
 
 
276 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  50 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  49.47 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  51.06 
 
 
273 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  49.65 
 
 
271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  50.88 
 
 
273 aa  232  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  48.41 
 
 
273 aa  232  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  50.35 
 
 
314 aa  232  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  52.11 
 
 
272 aa  232  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  51.24 
 
 
273 aa  232  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  49.65 
 
 
271 aa  231  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  46.39 
 
 
319 aa  231  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  52.63 
 
 
273 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  48.23 
 
 
274 aa  229  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  49.29 
 
 
271 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  48.42 
 
 
274 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  50.35 
 
 
273 aa  228  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  50.35 
 
 
272 aa  228  9e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  48.94 
 
 
287 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  49.65 
 
 
275 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  49.65 
 
 
275 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  52.28 
 
 
272 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  51.76 
 
 
273 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  50.74 
 
 
272 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  49.46 
 
 
275 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  48.21 
 
 
281 aa  225  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  48.41 
 
 
272 aa  224  9e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  48.76 
 
 
271 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  45.31 
 
 
319 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  47.72 
 
 
274 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  50.18 
 
 
273 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  48.57 
 
 
281 aa  223  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  48.41 
 
 
271 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  47 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  49.47 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  46.6 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  47.22 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  48.06 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  48.06 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  49.12 
 
 
274 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  50.17 
 
 
278 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  47.7 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  49.82 
 
 
271 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  49.12 
 
 
276 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  47.54 
 
 
272 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  50.89 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  44.01 
 
 
278 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  43.66 
 
 
278 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  48.72 
 
 
272 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  44.44 
 
 
275 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  44.21 
 
 
263 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  43.66 
 
 
278 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  43.57 
 
 
272 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  44.17 
 
 
263 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  44.56 
 
 
277 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  46.79 
 
 
272 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  43.26 
 
 
279 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  43.66 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  44.95 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  43.66 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  44.17 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  42.76 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  42.91 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  42.76 
 
 
266 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1284  flagellin domain-containing protein  47.16 
 
 
273 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3957  flagellin domain-containing protein  45.2 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0057  flagellin domain-containing protein  44.84 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0071  flagellin domain-containing protein  44.12 
 
 
377 aa  195  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0550639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3958  flagellin domain-containing protein  43.6 
 
 
268 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  41.76 
 
 
356 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  41.9 
 
 
327 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>