244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1507 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
523 aa  1040    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  56.95 
 
 
524 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  54.58 
 
 
521 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  51.53 
 
 
521 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  50.47 
 
 
530 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  50.09 
 
 
530 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  48.47 
 
 
520 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  33.69 
 
 
562 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  33.55 
 
 
433 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  38.89 
 
 
439 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  26.02 
 
 
532 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  40.76 
 
 
300 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  29.05 
 
 
404 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  37.82 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  30.85 
 
 
401 aa  114  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  34.59 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  31.4 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  34.43 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  29.46 
 
 
396 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  31.85 
 
 
406 aa  110  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  34.38 
 
 
411 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  33.33 
 
 
400 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  29.25 
 
 
396 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  33.85 
 
 
411 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  39.26 
 
 
305 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  29.04 
 
 
403 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  33.51 
 
 
402 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  29.64 
 
 
403 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  29.01 
 
 
403 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  35.52 
 
 
411 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  35.52 
 
 
411 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  29.01 
 
 
403 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 
403 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  34.97 
 
 
411 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  32.45 
 
 
402 aa  103  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  28.74 
 
 
403 aa  103  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
396 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  35.33 
 
 
305 aa  103  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  28.44 
 
 
403 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  31.67 
 
 
401 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  31.67 
 
 
401 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  34.43 
 
 
411 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  32.79 
 
 
400 aa  101  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 
406 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 
413 aa  100  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  28.83 
 
 
400 aa  100  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 
412 aa  100  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  32.26 
 
 
312 aa  99.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
413 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  28.86 
 
 
408 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  32.98 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
413 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  33.88 
 
 
407 aa  97.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  28.86 
 
 
400 aa  97.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
407 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
299 aa  95.5  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  34.81 
 
 
416 aa  95.1  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  29.89 
 
 
299 aa  93.6  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  34.04 
 
 
305 aa  93.2  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  36.02 
 
 
305 aa  92.8  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  27.93 
 
 
397 aa  92  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
396 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0649  flagellar hook-associated protein FlgL  30.37 
 
 
305 aa  90.1  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  32.93 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  30.52 
 
 
305 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  32.53 
 
 
305 aa  88.6  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  30.6 
 
 
317 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  30.6 
 
 
317 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  30.6 
 
 
317 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  30.6 
 
 
317 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  30.43 
 
 
317 aa  87.8  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  31.22 
 
 
410 aa  87.4  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  30.6 
 
 
317 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  31.72 
 
 
305 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  32.24 
 
 
296 aa  87.4  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  32.42 
 
 
304 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  0.00000747775 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  28.46 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  33.48 
 
 
304 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  29.23 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  31.4 
 
 
594 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  31.84 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  28.27 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  33.12 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  30.43 
 
 
403 aa  84  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  32.47 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  33.12 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  31.76 
 
 
504 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  34.64 
 
 
302 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  32.47 
 
 
317 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  32.47 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  32.47 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>