More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1432 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  100 
 
 
199 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  82.41 
 
 
199 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  81.91 
 
 
204 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  81.91 
 
 
199 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  81.91 
 
 
199 aa  341  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  78.89 
 
 
199 aa  337  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  77.89 
 
 
199 aa  331  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  69.04 
 
 
213 aa  292  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  8.9212e-06  hitchhiker  7.0742e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  67.51 
 
 
213 aa  288  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  53.27 
 
 
201 aa  209  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  51.52 
 
 
201 aa  204  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  51.01 
 
 
201 aa  201  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  50.75 
 
 
201 aa  201  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  51.01 
 
 
201 aa  201  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  51.01 
 
 
201 aa  201  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  51.52 
 
 
201 aa  199  2e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  48.99 
 
 
201 aa  196  1e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  48.99 
 
 
201 aa  196  1e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  49.49 
 
 
201 aa  197  1e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  47.74 
 
 
194 aa  195  4e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  48.99 
 
 
201 aa  195  4e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  48.99 
 
 
201 aa  194  5e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  48.99 
 
 
201 aa  194  5e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  48.99 
 
 
201 aa  194  5e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  48.99 
 
 
201 aa  194  5e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.99 
 
 
201 aa  194  5e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  48.48 
 
 
201 aa  193  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  5.99695e-06 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.81 
 
 
198 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.87 
 
 
198 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  47.87 
 
 
198 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.87 
 
 
198 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  47.87 
 
 
198 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.87 
 
 
198 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.34 
 
 
198 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  52.78 
 
 
201 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  52.78 
 
 
201 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  52.78 
 
 
201 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  52.78 
 
 
201 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  52.78 
 
 
201 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.19 
 
 
199 aa  188  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  49.23 
 
 
201 aa  188  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.44 
 
 
198 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.44 
 
 
198 aa  188  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  44.44 
 
 
237 aa  187  6e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  44.44 
 
 
237 aa  187  6e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.44 
 
 
237 aa  187  6e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  44.44 
 
 
237 aa  187  6e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  44.44 
 
 
237 aa  187  6e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  47.24 
 
 
213 aa  187  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.7 
 
 
198 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.25 
 
 
198 aa  185  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.7 
 
 
198 aa  185  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  48.72 
 
 
197 aa  184  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.06 
 
 
207 aa  183  1e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  2.37921e-06 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.94 
 
 
198 aa  183  2e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  43.94 
 
 
197 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  9.50602e-08 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  45.45 
 
 
197 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  44.44 
 
 
197 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.8989e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.08 
 
 
204 aa  175  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  45.08 
 
 
202 aa  174  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.18 
 
 
197 aa  174  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.08 
 
 
204 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.15 
 
 
232 aa  173  2e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  41.84 
 
 
199 aa  172  4e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.26863e-05  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  47.03 
 
 
217 aa  171  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  44.5 
 
 
198 aa  171  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  46 
 
 
196 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.74 
 
 
208 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.74 
 
 
208 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.35 
 
 
207 aa  167  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  44.72 
 
 
198 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.59762e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  44.72 
 
 
198 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.73737e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  44.72 
 
 
198 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  44.72 
 
 
198 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  6.41081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.42 
 
 
200 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  1.14134e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  44.39 
 
 
198 aa  165  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  44.39 
 
 
198 aa  165  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  44.39 
 
 
198 aa  165  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.33 
 
 
202 aa  163  1e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  3.9255e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.04 
 
 
195 aa  163  2e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  46.2 
 
 
208 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.93 
 
 
216 aa  161  5e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.41 
 
 
209 aa  161  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45.16 
 
 
191 aa  161  8e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.93 
 
 
216 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.98 
 
 
209 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41 
 
 
232 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.28 
 
 
206 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  39.8 
 
 
203 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  41 
 
 
232 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.93 
 
 
216 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  43.37 
 
 
206 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.82 
 
 
202 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  44.56 
 
 
198 aa  158  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.2 
 
 
199 aa  158  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.41 
 
 
215 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.7 
 
 
214 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.35 
 
 
193 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.7 
 
 
214 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.21 
 
 
204 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>