151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1317 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  46.67 
 
 		 174 aa  137  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  43.88 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  49.29 
 
 		 172 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  46.76 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  46.76 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  46.53 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  47.97 
 
 		 172 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  48.06 
 
 		 172 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  49.22 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  46.32 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  47.83 
 
 		 176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  41.3 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  44.29 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  44.09 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  44.44 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  43.07 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  43.17 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  39.86 
 
 		 146 aa  97.8  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  45.04 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  42 
 
 		 146 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  40 
 
 		 147 aa  95.5  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  38.62 
 
 		 151 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  38.89 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  40.98 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  42.48 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  39.23 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  39.57 
 
 		 147 aa  84  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  39.01 
 
 		 151 aa  84  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  39.57 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  38.3 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  39.57 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  38.85 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  42.07 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  33.56 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  38.93 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  34.72 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  32.19 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  38.46 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  38.46 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  30 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  36.11 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  38.73 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  35.62 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  34.53 
 
 		 318 aa  71.2  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  35.61 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  31.03 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  31.03 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  37.14 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  33.09 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.82 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  30.71 
 
 		 307 aa  68.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  35.61 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  31.54 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  32.64 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  29.37 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  36.13 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  37.86 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  34.59 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  35.92 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  36.62 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  30.22 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  35.92 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  27.78 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  27.78 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  32.58 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  31.86 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  31.75 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3463  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0977859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3471  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3229  membrane-spanning protein  30.71 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000183039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3455  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.229376  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  31.16 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3482  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0187664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3256  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0243517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3166  membrane-spanning protein  30.71 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.590312  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3511  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  31.39 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  31.88 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  30.17 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  31.88 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5702  hypothetical protein  33.12 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1793  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  31.69 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  29.71 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  31.69 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6654  protein of unknown function DUF606  33.79 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776475  normal  0.0686008 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  29.29 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  35.23 
 
 		 315 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  31.21 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  29.01 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  27.14 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  28 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>