More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1308 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  100 
 
 
260 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  81.15 
 
 
260 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  81.15 
 
 
260 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  77.31 
 
 
260 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  77.82 
 
 
259 aa  421  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  77.31 
 
 
260 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  76.92 
 
 
260 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  71.43 
 
 
260 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  71.04 
 
 
260 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  72.41 
 
 
262 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  71.81 
 
 
260 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  71.04 
 
 
260 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  71.04 
 
 
260 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  71.04 
 
 
260 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  70 
 
 
260 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  70.27 
 
 
260 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  70 
 
 
260 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  69.62 
 
 
260 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0451  class II aldolase/adducin domain protein  65.77 
 
 
261 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1957  class II aldolase/adducin domain protein  69.62 
 
 
260 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0280  class II aldolase/adducin domain protein  69.62 
 
 
260 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.594918  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0957  class II aldolase/adducin domain protein  69.62 
 
 
260 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0868  class II aldolase/adducin domain protein  69.62 
 
 
260 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  68.11 
 
 
258 aa  363  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4438  class II aldolase/adducin domain protein  61.09 
 
 
258 aa  342  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  55 
 
 
260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  35.27 
 
 
259 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  36.64 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  37.8 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  37.44 
 
 
260 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  35.24 
 
 
263 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  34.44 
 
 
244 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  37.06 
 
 
282 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  36.73 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  37.77 
 
 
282 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  35.68 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  33.83 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  35.24 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  37.16 
 
 
281 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  36.04 
 
 
268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  35.19 
 
 
298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  36.5 
 
 
283 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  34.33 
 
 
271 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4135  class II aldolase/adducin family protein  29.07 
 
 
240 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  36.68 
 
 
279 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  34.98 
 
 
280 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  36.08 
 
 
301 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0873  class II aldolase/adducin-like  31.84 
 
 
242 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.137021  normal  0.149254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  33.89 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  34.7 
 
 
274 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  33.89 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  33.89 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  33.89 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  35.68 
 
 
279 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  35.68 
 
 
279 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  33.47 
 
 
281 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  36.72 
 
 
301 aa  106  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  32.64 
 
 
279 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  36.46 
 
 
326 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1648  class II aldolase/adducin family protein  32.11 
 
 
276 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  33.49 
 
 
263 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  29.41 
 
 
279 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  33.02 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  33.68 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  30.92 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  30.18 
 
 
312 aa  95.5  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  33.01 
 
 
251 aa  93.2  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  32.84 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  30.26 
 
 
261 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6491  putative class II aldolase/adducin-like protein  30.5 
 
 
264 aa  92  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  30.41 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  29.36 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  32.49 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  29.23 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  28.38 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  32.16 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  30.62 
 
 
280 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  27.18 
 
 
219 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  29.34 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  31.96 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  28.64 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  28.57 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  30.43 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  30.77 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  30.91 
 
 
262 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  27.51 
 
 
263 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  29.59 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  28.69 
 
 
286 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  29.78 
 
 
257 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  29.95 
 
 
257 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  29.95 
 
 
257 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  29.95 
 
 
257 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  30.05 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  29.47 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  27.62 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  33.73 
 
 
222 aa  85.9  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  27.84 
 
 
214 aa  85.9  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  30.52 
 
 
250 aa  85.5  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  30.25 
 
 
260 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  32.99 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>