9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1062 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1062  putative lipoprotein  100 
 
 		 184 aa  383  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4119  lipoprotein  63.04 
 
 		 182 aa  224  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4224  hypothetical protein  60.87 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1103  lipoprotein  60.87 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1498  putative lipoprotein  60.33 
 
 		 182 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00314767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1440  putative lipoprotein  59.12 
 
 		 183 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16560  putative lipoprotein  58.01 
 
 		 183 aa  207  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3368  hypothetical protein  54.59 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39370  hypothetical protein  50.84 
 
 		 180 aa  161  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>