More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1052 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1488  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.23 
 
 		 540 aa  771    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159375  normal  0.199661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1493  methyl-accepting chemotaxis protein  78.52 
 
 		 540 aa  775    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1303  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  77.78 
 
 		 540 aa  800    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00176405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1052  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 540 aa  1092    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1429  putative chemotaxis transducer  71.4 
 
 		 542 aa  717    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75 
 
 		 540 aa  767    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.138218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.93 
 
 		 540 aa  781    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.23 
 
 		 540 aa  769    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16430  putative chemotaxis transducer  71.59 
 
 		 542 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.889289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.26 
 
 		 541 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3973  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.82 
 
 		 606 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259305  normal  0.0136642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3653  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  60.62 
 
 		 539 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.44224  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0501  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  58.66 
 
 		 558 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.28 
 
 		 558 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.253027 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.28 
 
 		 558 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142076  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.98 
 
 		 558 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0217  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.29 
 
 		 558 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482038  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.51 
 
 		 558 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1595  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.29 
 
 		 555 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0968  methyl-accepting chemotaxis transducer  58.29 
 
 		 558 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.09 
 
 		 558 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1398  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.29 
 
 		 555 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2687  methyl-accepting chemotaxis protein  58.29 
 
 		 546 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2542  methyl-accepting chemotaxis protein  58.29 
 
 		 546 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0254  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.29 
 
 		 546 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.09 
 
 		 558 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.34 
 
 		 558 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0772371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.34 
 
 		 558 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1462  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.01 
 
 		 564 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.01 
 
 		 564 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 		 411 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0232938 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1661  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  40 
 
 		 622 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1674  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  34.07 
 
 		 696 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.266076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.33 
 
 		 541 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  29.04 
 
 		 541 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.16 
 
 		 547 aa  176  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.4 
 
 		 540 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.42 
 
 		 540 aa  174  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 		 661 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.01 
 
 		 550 aa  169  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  29.51 
 
 		 541 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  27.96 
 
 		 541 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.8 
 
 		 542 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  27.78 
 
 		 541 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.61 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  26.8 
 
 		 549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.82 
 
 		 549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.09 
 
 		 425 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  33.05 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  31.45 
 
 		 541 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  27.75 
 
 		 541 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  25.91 
 
 		 544 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.34 
 
 		 519 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.35 
 
 		 519 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.418042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.39 
 
 		 569 aa  160  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  26.63 
 
 		 539 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.05 
 
 		 525 aa  160  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.53 
 
 		 547 aa  160  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  29.2 
 
 		 543 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.4 
 
 		 533 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 		 598 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  26.45 
 
 		 539 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.14 
 
 		 673 aa  156  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.12 
 
 		 544 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  30.5 
 
 		 674 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.03 
 
 		 452 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 535 aa  153  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  29.13 
 
 		 541 aa  153  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.07 
 
 		 540 aa  153  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  25.58 
 
 		 546 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 		 674 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.44 
 
 		 542 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  31.45 
 
 		 533 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.19 
 
 		 666 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.86 
 
 		 549 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.41 
 
 		 544 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.3 
 
 		 644 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.37 
 
 		 543 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2477  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.56 
 
 		 617 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.57 
 
 		 540 aa  150  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.73 
 
 		 520 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.88 
 
 		 568 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000211004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.08 
 
 		 550 aa  150  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.55 
 
 		 540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.18 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 		 541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.04 
 
 		 546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  30.17 
 
 		 539 aa  148  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  27.29 
 
 		 541 aa  148  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  24.82 
 
 		 546 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.71 
 
 		 541 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.33 
 
 		 546 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.76 
 
 		 544 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.77 
 
 		 570 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.39 
 
 		 621 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.650368  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  31.03 
 
 		 645 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0500  methyl-accepting chemotaxis protein  25.42 
 
 		 543 aa  146  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.64 
 
 		 679 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.17 
 
 		 540 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>