32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0979 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  324  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  80 
 
 		 174 aa  266  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  76.13 
 
 		 158 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  74.84 
 
 		 158 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  74.19 
 
 		 158 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  76.97 
 
 		 156 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  79.22 
 
 		 163 aa  248  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  68.67 
 
 		 163 aa  222  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  67.32 
 
 		 156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  66 
 
 		 159 aa  213  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  64.47 
 
 		 157 aa  206  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  64.05 
 
 		 157 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  64.05 
 
 		 157 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  64.05 
 
 		 157 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  66.44 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  62.67 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  64.19 
 
 		 160 aa  184  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  49.35 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  53.42 
 
 		 165 aa  146  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  42.95 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  46.71 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  46.1 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  48.37 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  30.56 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3840  hypothetical protein  28.8 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223195  normal  0.195443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  25.17 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  27.97 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  26.62 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3124  RNA polymerase factor sigma-70  44 
 
 		 334 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.093145  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12753  hypothetical protein  28.06 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384763  normal  0.0262942 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3232  RNA polymerase factor sigma-70  45.65 
 
 		 334 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0107051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>