140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0899 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  100 
 
 		 128 aa  244  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  70.87 
 
 		 128 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  70.08 
 
 		 128 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  70.08 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19680  hypothetical protein  65.85 
 
 		 129 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1694  hypothetical protein  65.04 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  45.87 
 
 		 162 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  41.23 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  43.8 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  43.97 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  45.28 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  40.16 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  51.43 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  50 
 
 		 158 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  40.16 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  51.43 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  36.72 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  50 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  50 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  48.31 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  48.57 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  35.04 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  36.52 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  36.52 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  35.65 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  35.65 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  35.65 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  35.65 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  35.65 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  35.04 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  35.04 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  34.78 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  40.35 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0024  LrgA family protein  46.07 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0237  LrgA family protein  44.94 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0025  LrgA family protein  44.94 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2768  LrgA family protein  44.94 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3500  LrgA family protein  44.94 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1871  LrgA family protein  44.94 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0026  LrgA family protein  44.94 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2681  LrgA family protein  44.94 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  39.33 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  33.04 
 
 		 248 aa  64.3  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3050  LrgA family protein  37.25 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119689  normal  0.0263199 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0885  LrgA family protein  37.11 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000433815  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  30.09 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1047  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3389  LrgA family protein  39.58 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0954  LrgA family protein  39.58 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0989  LrgA family protein  39.58 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0975  LrgA family protein  39.58 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0922  LrgA family protein  37.11 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  42.16 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  36.46 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  34.21 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  39.5 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  39.5 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4524  LrgA family protein  39.17 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4617  LrgA family protein  39.17 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4615  LrgA family protein  39.17 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.299586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  34.17 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  44.83 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  35.42 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  44.83 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  30.83 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  31.67 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4960  holin-like protein  30.83 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4812  holin-like protein  30.83 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4822  holin-like protein  30.83 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5247  holin-like protein  30.83 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.697113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4925  holin-like protein  30.83 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.365696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5218  holin-like protein  30.83 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5282  holin-like protein  30.83 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000144803  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0268  hypothetical protein  41.33 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  30.83 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3025  LrgA family protein  35.29 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  35.51 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2927  holin-like protein  40.45 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00321045  normal  0.271061 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  28.7 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0902  LrgA family protein  31.68 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  34.19 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0829  LrgA family protein  35.87 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  35.16 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  27.83 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  42.7 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  31.09 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0273  hypothetical protein  41.56 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1606  LrgA  37.33 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  35.34 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0083  LrgA  44.83 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177337  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2908  LrgA family protein  35.34 
 
 		 167 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  32.43 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  34.91 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  27.62 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  25.23 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0893  LrgA family protein  34.95 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  33.88 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3677  holin-like protein  30.51 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  29.41 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  29.41 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>