More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0874 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  62.54 
 
 
696 aa  877    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  62.82 
 
 
696 aa  881    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  82.1 
 
 
703 aa  1186    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  81.25 
 
 
703 aa  1176    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
701 aa  1434    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  61.06 
 
 
703 aa  856    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  60.68 
 
 
708 aa  850    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  56.6 
 
 
709 aa  787    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  61.47 
 
 
692 aa  818    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  46.19 
 
 
710 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  44.56 
 
 
708 aa  571  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  42.94 
 
 
734 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 
708 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  42.94 
 
 
709 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  42.7 
 
 
710 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  41.84 
 
 
711 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  42.92 
 
 
711 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  41.83 
 
 
714 aa  524  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  42.64 
 
 
736 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  41.05 
 
 
732 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  43.22 
 
 
738 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  41.89 
 
 
689 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  41.83 
 
 
741 aa  502  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  41.97 
 
 
722 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  41.18 
 
 
689 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  41.14 
 
 
730 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  39.91 
 
 
715 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  39.15 
 
 
703 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  39.43 
 
 
722 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  39.14 
 
 
689 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  38.41 
 
 
701 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  39.4 
 
 
757 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  37.22 
 
 
712 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  38.1 
 
 
701 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 
701 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  38.5 
 
 
701 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  40.3 
 
 
722 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  37.15 
 
 
701 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  38.35 
 
 
701 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  38.35 
 
 
701 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  37.63 
 
 
702 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  37.63 
 
 
702 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  38.1 
 
 
713 aa  416  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  34.93 
 
 
724 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  33.7 
 
 
723 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 
720 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 
724 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 
720 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 
710 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 
720 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 
720 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  35.55 
 
 
714 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 
715 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 
720 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  33.23 
 
 
707 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
699 aa  336  7.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 
860 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 
720 aa  330  7e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  33.64 
 
 
850 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 
726 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 
862 aa  323  8e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 
817 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
726 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 
743 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 
859 aa  313  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 
864 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 
698 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 
843 aa  300  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 
726 aa  296  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 
799 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  33.95 
 
 
795 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 
837 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  34.86 
 
 
795 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
689 aa  290  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.47 
 
 
833 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 
825 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  33.01 
 
 
689 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 
825 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 
707 aa  274  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 
792 aa  273  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 
700 aa  271  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 
796 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 
810 aa  270  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 
796 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 
796 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.02 
 
 
806 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 
815 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.23 
 
 
797 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.97 
 
 
724 aa  264  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 
708 aa  264  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 
829 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.65 
 
 
706 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 
705 aa  261  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 
707 aa  261  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  29.7 
 
 
799 aa  259  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 
778 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
721 aa  259  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  29.8 
 
 
713 aa  259  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  29.8 
 
 
713 aa  259  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 
730 aa  258  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>