More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0858 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  100 
 
 
241 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  95.02 
 
 
241 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  95.44 
 
 
241 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  95.85 
 
 
241 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  95.02 
 
 
241 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  95.02 
 
 
241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  95.02 
 
 
241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  91.29 
 
 
241 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  89.21 
 
 
241 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  87.97 
 
 
241 aa  440  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  89.21 
 
 
241 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  75.1 
 
 
259 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  71.37 
 
 
241 aa  364  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  72.2 
 
 
241 aa  363  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  71.97 
 
 
243 aa  360  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  72.2 
 
 
241 aa  359  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  71.37 
 
 
241 aa  357  8e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  70.95 
 
 
241 aa  355  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  70.95 
 
 
241 aa  355  2.9999999999999997e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2714  ABC transporter related  74.27 
 
 
241 aa  354  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  70.71 
 
 
246 aa  353  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2417  ABC transporter related  72.2 
 
 
241 aa  351  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0204694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  70.12 
 
 
241 aa  348  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  72.8 
 
 
243 aa  347  8e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  72.8 
 
 
243 aa  347  8e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  72.8 
 
 
243 aa  347  8e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  72.8 
 
 
243 aa  347  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  72.8 
 
 
243 aa  347  8e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  72.8 
 
 
243 aa  347  8e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  72.8 
 
 
243 aa  347  8e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  72.38 
 
 
243 aa  347  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  73.64 
 
 
243 aa  346  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  70.12 
 
 
241 aa  346  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  68.88 
 
 
241 aa  346  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  69.29 
 
 
241 aa  343  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  72.69 
 
 
243 aa  343  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  67.63 
 
 
265 aa  342  4e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  68.88 
 
 
241 aa  342  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  71.97 
 
 
243 aa  340  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  71.13 
 
 
243 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  71.55 
 
 
243 aa  340  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  67.22 
 
 
265 aa  339  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  70.83 
 
 
243 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  66.8 
 
 
241 aa  338  5e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  66.39 
 
 
241 aa  337  7e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  67.22 
 
 
241 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  69.29 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  68.05 
 
 
241 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  68.05 
 
 
241 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  71.97 
 
 
243 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  65.56 
 
 
241 aa  334  7e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1152  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  70.12 
 
 
241 aa  333  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0442  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  70.12 
 
 
241 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0506  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  70.12 
 
 
241 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.503338  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  66.8 
 
 
241 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  66.8 
 
 
241 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  66.8 
 
 
241 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  66.8 
 
 
241 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  67.22 
 
 
241 aa  332  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  66.8 
 
 
241 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  63.9 
 
 
241 aa  329  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  66.39 
 
 
241 aa  328  3e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  66.39 
 
 
241 aa  328  3e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  65.13 
 
 
239 aa  324  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  66.52 
 
 
271 aa  322  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  67.22 
 
 
241 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  67.22 
 
 
241 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  67.22 
 
 
241 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  67.22 
 
 
241 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  67.22 
 
 
241 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  67.22 
 
 
241 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  63.87 
 
 
239 aa  320  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  67.22 
 
 
241 aa  320  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  67.22 
 
 
241 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  67.22 
 
 
241 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  64.29 
 
 
247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  62.92 
 
 
268 aa  311  5.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  60.42 
 
 
310 aa  309  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  61.41 
 
 
240 aa  308  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  62.34 
 
 
240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  62.34 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  59.84 
 
 
255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  62.24 
 
 
244 aa  300  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  59.51 
 
 
262 aa  298  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  59.04 
 
 
263 aa  298  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  59.26 
 
 
255 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  61.25 
 
 
240 aa  296  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
277 aa  295  4e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
254 aa  294  7e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  59.17 
 
 
279 aa  294  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  60.42 
 
 
261 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  58.2 
 
 
266 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  60.08 
 
 
268 aa  292  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  57.79 
 
 
262 aa  291  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  58.13 
 
 
262 aa  291  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  58.13 
 
 
262 aa  291  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  56.63 
 
 
264 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  57.98 
 
 
244 aa  289  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  59.41 
 
 
247 aa  289  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>