More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0792 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  100 
 
 		 331 aa  666    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0820  DNA-binding transcriptional regulator FruR  78.72 
 
 		 331 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0953  fructose repressor FruR, putative  78.42 
 
 		 331 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  77.74 
 
 		 331 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  77.44 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  78.05 
 
 		 331 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4401  DNA-binding transcriptional regulator FruR  77.74 
 
 		 331 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18230  DNA-binding transcriptional regulator FruR  68.88 
 
 		 329 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0329354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1582  DNA-binding transcriptional regulator FruR  68.58 
 
 		 329 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0785  DNA-binding transcriptional regulator FruR  65.86 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12180  DNA-binding transcriptional regulator FruR  66.46 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382176  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05957  DNA-binding transcriptional regulator FruR  49.24 
 
 		 331 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000221  fructose repressor FruR LacI family  49.24 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0089  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.4 
 
 		 325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2649  DNA-binding transcriptional regulator FruR  52.28 
 
 		 337 aa  295  7e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3550  DNA-binding transcriptional regulator FruR  48.63 
 
 		 327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3791  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.73 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00081  DNA-binding transcriptional dual regulator  47.88 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0086  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.88 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00080  hypothetical protein  47.88 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3603  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.13 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0073  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.88 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0085  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.88 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0082  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.88 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3577  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.88 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0088  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.88 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.936017 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3520  transcriptional regulator, LacI family  47.88 
 
 		 334 aa  275  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0127  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.88 
 
 		 334 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0134  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.88 
 
 		 334 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0135  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.88 
 
 		 334 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.88 
 
 		 334 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000945493 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.88 
 
 		 334 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0750  DNA-binding transcriptional regulator FruR  48.35 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0626  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.69 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.800956  normal  0.256043 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0452  DNA-binding transcriptional regulator FruR  48.01 
 
 		 326 aa  272  6e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0598  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.11 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3529  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.81 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3399  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.81 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2929  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.81 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0636  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.67 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4207  LacI family transcription regulator  33.12 
 
 		 347 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3596  transcriptional regulator, LacI family  32.69 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2023  LacI family transcription regulator  30.51 
 
 		 338 aa  159  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0347  transcriptional regulator, LacI family  32.43 
 
 		 339 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.427458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0391  transcriptional regulator, LacI family  32.23 
 
 		 339 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.133972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2909  sucrose operon repressor  30.21 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00007545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3759  transcriptional regulator, LacI family  32.05 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.899629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3916  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02648  L-fuculose phosphate aldolase  32.91 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0874  transcriptional regulator, LacI family  31.43 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  27.24 
 
 		 345 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 353 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  35.27 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.84 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  28.75 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.21 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  32.7 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  34.88 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  26.58 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2811  regulatory protein LacI  28.17 
 
 		 412 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4042  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.06 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  31.48 
 
 		 338 aa  116  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 346 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  28.71 
 
 		 347 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  30.27 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  28.52 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  29.39 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2056  LacI family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 344 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.727085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3944  transcriptional regulator, LacI family  25.62 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2287  LacI family transcription regulator  26.24 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  24.35 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  32.69 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  31.03 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4614  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  28.89 
 
 		 332 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  25.31 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  27.06 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  26.65 
 
 		 326 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  23.34 
 
 		 327 aa  108  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  29.33 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5308  transcriptional regulator, LacI family  27.48 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3640  regulatory protein LacI  25.88 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  29.21 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  27.06 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.92 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  26.67 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  27.39 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  26.67 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  29.32 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  28.93 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  26.67 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  26.67 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  26.67 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1526  transcriptional regulator, LacI family  27.47 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.291045  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  31.14 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  28.8 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  28.08 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>