245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0756 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  89.51 
 
 		 467 aa  799    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  88.01 
 
 		 478 aa  808    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 467 aa  917    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  71.31 
 
 		 467 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  50.98 
 
 		 452 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  48.28 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  48.25 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  50.54 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  48.46 
 
 		 464 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  47.06 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  46.07 
 
 		 464 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  46.84 
 
 		 446 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  43.13 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  43.41 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  42.92 
 
 		 450 aa  385  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  45.84 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  43.13 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  47 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  42.92 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  44.03 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  45.67 
 
 		 455 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  43.82 
 
 		 452 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  43.48 
 
 		 486 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  45.47 
 
 		 486 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  42.95 
 
 		 461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  41.48 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  41.13 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  42.89 
 
 		 446 aa  315  8e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  41.94 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  39.66 
 
 		 454 aa  302  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  37.01 
 
 		 452 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  38.01 
 
 		 463 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  37.77 
 
 		 452 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  38 
 
 		 468 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  36.8 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  37.88 
 
 		 453 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  36.23 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  36.23 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  36.23 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  36.01 
 
 		 446 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  36.01 
 
 		 446 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  36.48 
 
 		 446 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  40.35 
 
 		 463 aa  276  4e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  36.23 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  35.57 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  36.18 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  36.04 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.64 
 
 		 453 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  35.7 
 
 		 453 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  36.48 
 
 		 456 aa  266  7e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  35.39 
 
 		 455 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  35.26 
 
 		 455 aa  259  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.53 
 
 		 476 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  36.44 
 
 		 450 aa  257  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  36.04 
 
 		 465 aa  256  9e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  37.47 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  35.13 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  37.42 
 
 		 449 aa  254  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  37.58 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  37.58 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  37.36 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  35.08 
 
 		 454 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  34.57 
 
 		 483 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  38.29 
 
 		 445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  37.14 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  37.94 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  37.14 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  37.94 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  37.14 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  37.94 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  37.14 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  38.07 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  35.84 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  37.86 
 
 		 445 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  37.94 
 
 		 445 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  37.94 
 
 		 445 aa  244  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  37.36 
 
 		 452 aa  242  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  37.36 
 
 		 452 aa  242  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  34.78 
 
 		 469 aa  241  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  37.77 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  32.11 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  32.11 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  34.81 
 
 		 459 aa  240  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  37.06 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  35.2 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  37.36 
 
 		 452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  37.77 
 
 		 447 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  29.59 
 
 		 454 aa  236  8e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  34.5 
 
 		 443 aa  236  8e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  38.13 
 
 		 475 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  31.75 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  37.2 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  29.4 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  29.4 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  34.42 
 
 		 447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3369  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 		 528 aa  232  9e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0936236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  36.61 
 
 		 461 aa  231  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  29.76 
 
 		 458 aa  230  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  28.94 
 
 		 447 aa  230  5e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  32.79 
 
 		 470 aa  229  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>