More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0725 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  71.01 
 
 		 343 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  68.62 
 
 		 344 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  71.3 
 
 		 343 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 337 aa  292  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0593  putative transcriptional regulator  38.62 
 
 		 348 aa  242  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5360  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 353 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 353 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  29.26 
 
 		 353 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 353 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  31.86 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  30.82 
 
 		 348 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  30.87 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5762  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  30.31 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  29.18 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 364 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 349 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  43.52 
 
 		 198 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  32.75 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  28.09 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  24.77 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  28.53 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2808  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  34.31 
 
 		 353 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3485  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.3 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.57 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 335 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  28.93 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  31.86 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  27.51 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6754  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2544  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4941  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3219  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  24.1 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05257  hypothetical protein  32.4 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  27.21 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  29.56 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  29.43 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3194  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857429  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  26.18 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  28.74 
 
 		 365 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  28.73 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  23.84 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  26.95 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  27.31 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>