More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0693 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  100 
 
 		 166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  68.48 
 
 		 172 aa  224  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  69.93 
 
 		 162 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  70.63 
 
 		 163 aa  207  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  72.03 
 
 		 163 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  57.62 
 
 		 165 aa  194  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  52.87 
 
 		 168 aa  181  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  52.87 
 
 		 168 aa  181  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  52.87 
 
 		 168 aa  181  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  53.46 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  56.16 
 
 		 186 aa  163  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  55.24 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  46.5 
 
 		 167 aa  150  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  42.41 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  48.61 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  40.51 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  46.71 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  46.71 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  44.67 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  39.49 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  39.49 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  39.49 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  39.49 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  39.49 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  46.05 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  39.49 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  39.49 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  44.29 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.44 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  43.97 
 
 		 170 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  39.72 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 206 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 206 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 215 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 403 aa  88.6  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.48 
 
 		 237 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.52 
 
 		 248 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 216 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 216 aa  84  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 		 216 aa  84  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  42.45 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  41.24 
 
 		 328 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 		 305 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 217 aa  81.3  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  37.41 
 
 		 319 aa  81.3  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 236 aa  80.9  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  42 
 
 		 333 aa  80.9  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 217 aa  80.5  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  38.53 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  36.23 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  40 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 464 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  47.3 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.91 
 
 		 607 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  36.69 
 
 		 319 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  36.45 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  34.92 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  40.91 
 
 		 267 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  50 
 
 		 321 aa  78.2  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  51.39 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03342  hypothetical protein  31.54 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 239 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  40 
 
 		 220 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.38 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  30.07 
 
 		 623 aa  77  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  37.84 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  39.81 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  44.94 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.85 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  35.83 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  39.81 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  36.54 
 
 		 464 aa  75.9  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  40.52 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  36.21 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>