More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0577 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  100 
 
 		 316 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  73.19 
 
 		 317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  73.04 
 
 		 319 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  72.73 
 
 		 319 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  69.09 
 
 		 314 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  68.45 
 
 		 314 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  72.96 
 
 		 318 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  57.1 
 
 		 313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.38 
 
 		 323 aa  311  9e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  49.7 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  49.7 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  49.7 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  49.7 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  49.7 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898218 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  49.84 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  49.84 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  49.84 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  49.84 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  49.84 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  50.47 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  49.84 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  50.16 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  49.22 
 
 		 306 aa  298  9e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  53.31 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  50 
 
 		 324 aa  288  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  51.23 
 
 		 320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  46.37 
 
 		 341 aa  277  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  50.47 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  46.37 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  44.51 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  43.57 
 
 		 313 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  45.48 
 
 		 308 aa  248  9e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  44.69 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  42.9 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  42.94 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.59 
 
 		 315 aa  242  7e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  49.84 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  49.84 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  43.71 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  42.64 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.9 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  45.25 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  41.69 
 
 		 326 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.55 
 
 		 324 aa  228  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  44.34 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.12 
 
 		 316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  44.76 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.03 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.26 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  46.69 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  41.51 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  43.48 
 
 		 296 aa  222  8e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  43.48 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  42.02 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  44.41 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  43.59 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  42.68 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  47.52 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  42.24 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.98 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.73 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  40.45 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  42.68 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.13 
 
 		 289 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.59 
 
 		 326 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.88 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  43.69 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  43.5 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  42.09 
 
 		 314 aa  202  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  38.64 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.72 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  36.92 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.08 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.18 
 
 		 287 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.07 
 
 		 347 aa  192  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  38.08 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  38.24 
 
 		 324 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.75 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  39.82 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  39.68 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  37.42 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1433  DnaJ protein  40.06 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1364  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.74 
 
 		 293 aa  186  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 		 376 aa  185  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 		 376 aa  185  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 		 376 aa  185  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 		 376 aa  185  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  36.57 
 
 		 376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  36.11 
 
 		 375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  35.2 
 
 		 383 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  43.08 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  36.57 
 
 		 376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  34.94 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  36.29 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  36.29 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  42.86 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  37.85 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.96 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  34.06 
 
 		 380 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>